主题:【原创】电脑是如何测量抑菌圈直径的--------计算机算法

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用计算机来测量微生物的物理指标最常用的就是抑菌圈实验,把做好带抑菌圈的培养皿放在成像设备中拍一张图片,下来就可以用电脑软件来测量计算了。
电脑是怎样计算出抑菌圈的直径呢?
首先说一下抑菌圈不是标准的几何图形的圆,这一点我是外行,论坛里的生物老师是专家,我对抑菌圈的理解是一种菌群在另一种菌群的地盘上奋力拼杀争夺的一块圆圆的面积,抑菌圈的边缘是两种菌群的边界。抑菌圈的面积和直径是表示菌力的综合表征,影响因素分内外因素,内因有菌群的多少(质量)、菌体的活性、敏感程度等,外因有培养皿底部的平整程度,培养基的质量和多少、培养温度的均匀、样品菌和工作菌接触面的平整性(牛津杯法、纸片法、打孔法)等。
从上世纪90年代初期中检院的老师们提出抑菌圈扫描成像法到现在国内的抑菌圈测量软件都是对抑菌圈成像设备调节阈值得到一张二值化的抑菌圈像素点(像素的的长宽是固定的数值)及面积,再换算出直径。出厂前用标准模板校准。
2015年后我们研究出了《免疫动态比浊仪》采用美国专业图像软件来完成平板中图像的测量,它的算法是不规则图形先找到它的几何形心(密度相同时实物的形心和质心一致),连接图形轮廓上两点并通过形心的平均长度是每隔两度测量一次,共90条直径数值的平均值。(此算法更加精确了生物细菌的运动规律)
形心:面的形心就是截面图形的几何中心,质心是对实物体而言的,而形心是针对抽象几何体而言的,对于密度均匀的实物体,质心和形心重合。
质心:质量中心简称质心,指物质系统上被认为质量集中于此的一个假想点。
刚心:刚度中心是在不考虑扭转情况下各抗侧力单元层剪切力的合力中心。
计算方法与形心计算方法类似,把抗侧力单元的抗侧刚度作为假想面积,求得各个假想面积的总形心就是刚度中心。
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以前做过好几年抑菌圈的测量和计算,虽说抑菌圈不是正圆,一般只要牛津杯放得正,产生的抑菌圈还是比较圆的。
雾非雾
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用电脑来测抑菌圈不需要有个标准的定位孔以确定一切数据的起始点及相对位置么?就像在电脑里建计算机人体模型时,就需要对人体组织的所有切片照像,为了把切片像片数字化,在像片上就都有定位孔以便确定所有组织间的相对位置的。
v3024149
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楼上版主:其它软件的定位点我不知道,我用的这种软件,对测量目标的定位是以界面的左上角为原点,测量后自动按坐标给出序号。很方便,用的很顺手。
Insp_6e4183d2
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