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安捷伦质谱化学工作站数据分析软件导出检索结果的小技巧
香精香料数据往往比较复杂,需要准确、高效、快速的数据处理方法。虽然有更好更快捷准确的方法,但有时候手头条件所限,只能选择一些基础常用方法。下面介绍安捷伦质谱化学工作站数据分析软件导出检索结果一些小技巧。
方法流程是:
调用要分析的
GCMS数据文件--选择合理的积分参数--积分--导出excel谱库检索结果报告--核对结果--整理最终报告。
1 调用要分析的
GCMS数据文件
File----Load file…
2 选择合理的积分参数并积分
选择相应的积分参数,使所需要的峰都积分上,不需要的峰或基线噪声不积分。例如,可以不同时间段选用不同的积分阈值(灵敏度),峰面积过滤噪声,Tangent skim处理大峰尾巴上面的小峰,不同大小的峰采样不同峰宽参数等等。仔细对比积分结果,选择最合理的积分参数。对于无法使用积分参数积分的小峰,可以使用使用手动积分来补充。因为没有积分的峰是无法进行自动检索的,无法导出检索结果的。
3 导出excel谱库检索结果报告
导出报告----谱库检索结果报告导出excel
得到excel表格,
可以看到峰的检索结果的候选化合物有20个,这个是默认设置为20个候选化合物。这个是太多了,不必要的还要删掉,整理结果花费的时间就多了。另外电脑也需要较长的时间来运行。那么怎样少一些候选结果呢?方法如下:
在质谱spectrum----编辑策略
Search Strategy的Max hit listed设置小一点的数字,例如3或5。这样就不会出现很大候选结果了。
这样导出的结果就只有3个候选结果了。注意保存方法。
4核对结果
删掉不需要的列。核对候选化合物,选择合适的结果,删去其它候选化合物。
5整理最终报告。
如何得到更好的结果呢?例如检索到更小的峰,得到更好匹配度,以更利于检索准确结果呢?
积分参数更为合理+手动积分;整体扣背景Subtract Background(BSB)。
例如,先进行BSB。
把上图的三个没有积分的峰进行手动积分。
在导出的excel表格中,删掉不必要不正确的列或行,仔细核对。核对或添加用其它方式检索的结果。例如手动检索,amdis检索,NIST Search等软件的结果。有条件的话,利用保留指数核对结果。