主题:【已应助】GCMS相似度检索不到——新人

浏览 |回复9 电梯直达
Ins_d8462639
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
1、用包含了曲线的sim方法扫描的混标,出峰正常,相应的目标离子、参考离子也没有问题。做相似度检索的时候不匹配,如甲基苯丙胺,库都有,但是搜索不出来是什么原因?

2、相同的sim方法,加载到以前用其他方法做的数据文件,又可以检索到。
名 称英文名cas号
甲基苯丙胺Methamphetamine537-45-2




最佳答案:安平回复于2021/08/20
  首先,基本要求,必须是scan方式采集到的数据,才可以进行谱库检索。

  sim方式不可以。

    SIM方式不能获得全部的质谱信息,不可以用以定性。


    其二,sim方式的定量数据文件,并非是通过谱库检索确定的物质名称,而是原先方法文件中的保留时间和碎片信息综合获得。
为您推荐
sdlzkw007
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
检索的时候需要全扫描的数据,否则可能无法与数据库匹配。
妙呀
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
sim不能检索谱库碎片信息太少,用scan采集的就能检索到了。
同行呀,做的东西都一样,哈哈哈
安平
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
  首先,基本要求,必须是scan方式采集到的数据,才可以进行谱库检索。

  sim方式不可以。

    SIM方式不能获得全部的质谱信息,不可以用以定性。


    其二,sim方式的定量数据文件,并非是通过谱库检索确定的物质名称,而是原先方法文件中的保留时间和碎片信息综合获得。
dahua1981
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
介绍下如何自建库,通常在进行定性检测的是候,对某张质谱图拿不准时,会采用谱图叠加的方法来判断两张图是不是指向同一种物质,如果保留时间完全吻合还好,否则,谱图不能完全重叠,也是很考验眼力的一件事情,或是另一种情况,一张图丰度很高,另一张丰度很低,这样,叠谱的话,一张谱成了另一张谱的基线也是很纠结的事情,这个时候,如果实验室做同一种物质的检测,可能考虑把这些目标物的质谱图收集起来做一个自已谱库,让电脑自动在这个谱库中进行匹配,找到最相似的物质,即避免了保留时间的差异,也不用担心丰度的问题。

第一步:建立自已的谱库
点击“spectrum-->edit library”,出现下图对话框,



选择“creat library”即创建谱库, 选持保存的路径,并为自已的库命个名。点OK后回到上面那个对话框,点击取消。这样,自已的谱图库就建好了,不过,这个库还是空的,要自已添加谱图进去。

第二步:为自已的谱库添加图谱
打开一张标准物质的谱图,如果是混标,则需要为每一种物质单独添加其质谱信息到库中。

举例:我们将配制的4-9PBDES混标的的谱图依次加入到库中,打开谱图后,将9PBDE的离子图放大,然后右键击得到其质谱图,再次点击,点击“spectrum-->edit library”选择第二项,“Add new entry”,出现如下添加窗口,



将目标物名称,分子式,分子量计算机会自动算出来,三项填完后,就可确定退出,这样,第一个物质的质谱图就成功添加到了目标库。然后依上面操作顺序分别将其他的物质的质谱图加入库中。

打开一个样品谱图,对可疑的峰双击右键吧,看看系统帮你找到了什么?下图是我们一个样品实例。



图中黑色质谱图是样品中检测到的可疑质谱峰,蓝色质谱图是自建库中10PBDE的标准谱,可疑质谱峰虽然丰度很低,但通过自建库检索,计算机还是识别出它是10PBDE的一种异构体。

注意:

1.分子式这项尽量填准确,因为这关系到后面分子量的计算,计算机将会将其计算的分子量与质谱图中的离子峰匹配,相差太大的话,计算机也无法将其与谱库匹配),

2.添加质谱图时要注意确定是加入到了自已建的库中,确认的方式就是看添加窗口的标题栏上的库名是不是目标库。



3. 尽量选择溶度高的标准物质的质谱图,因为这样的质谱图中的峰足够清晰,以利于计算机的检索。

4. 可能同时将SCAN图与SIM图都加入到同一库中,提高计算机检索的准确性。
安平
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
    楼主没有提到  自建谱库的问题吧??
深蓝
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
需要检索相似度时,一定要SCAN模式,SIM模式采集的离子太少了
Ins_d8462639
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
原文由 sdlzkw007(sdlzkw007) 发表:
检索的时候需要全扫描的数据,否则可能无法与数据库匹配。
谢谢老师
Ins_d8462639
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
原文由 妙呀(Insm_27beaf3b) 发表:
sim不能检索谱库碎片信息太少,用scan采集的就能检索到了。
同行呀,做的东西都一样,哈哈哈
司法鉴定啊,新人向老师学习
Ins_d8462639
结帖率:
100%
关注:0 |粉丝:0
新手级: 新兵
原文由 深蓝(mitsumi) 发表:
需要检索相似度时,一定要SCAN模式,SIM模式采集的离子太少了
谢谢老师