主题:【第十四届原创】应用MassHunter未知物分析处理数据3—保留指数核对分析结果

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应用MassHunter未知物分析处理数据3—保留指数核对分析结果



香气样品或香精样品数据往往比较复杂,组分多,数据处理一般比较耗时费力。有自动化的数据处理就比较好了。Masshunter的未知物分析是个不错的数据自动分析软件。上两次分别介绍应用MassHunter的未知物分析来进行处理香气样品数据和接卷积效果对比。大家知道仅仅依靠质谱图检索结果往往可能会存在不确定性。这是因为一些化合物的质谱图往往相似,特别对于一些异构体,同系物和结构特征相似的化合物,由于其质谱图非常相似,谱库检索结果匹配度,排列次序都很接近,检索给出的顺序或最佳匹配(best hit)也不一定正确。但它们的保留时间或保留指数会不同。虽然在相同的柱子上和相同的色谱条件下,两个不同的化合物的保留指数有可能相同。但两个化合物同时具有相同的保留指数(或保留时间)和相同的质谱图的不可能性极小。所以在谱库检索的基础上,用保留指数来确认结果。是一种很重要的手段。未知物分析软件通常也是给出最佳匹配结果(best hit)。如果使用保留指数进行校正来筛选就可以获得更为准确的数据分析结果。

如何进行保留指数核对也是许多网友关心的问题,无从下手,同时也缺乏相关资料或介绍。本篇以unknown analysis 10.1英文版为例介绍分析结果的进一步核对选择,以及保留指数校正核对。

未知物分析是MassHunter的定量软件附带一个软件,在安装时候定量软件时候可以选择经典或Quant-my-way等模式,或两个都选。分别得到以下两种图标(英文版):



Classic



Quant-my-way

Classic软件打开的界面(英文版)如下:



Quant-my-way的界面(英文版)为:



Quant-my-way的界面中文如下:



经典模式和Quant-my-way模式差别是,前者是菜单界面形式,后者是以可视工具栏界面形式,更为方便一些,但两者功能是一样的。

下面以英文版为例介绍检索结果的RI保留指数核对。

1 创建RI校正文件

首先进一针正构烷标准(一般0.05-0.1%浓度,C6-C30左右,分流比50:1左右)来得到正构烷保留值数据。然后建立保留指数表。

点击未知物分析软件的file文件菜单的New Analysis新建分析,例如RI_Calibration.uaf分析。



添加正构烷数据文件样品,添加样品Add sample,





浏览与复制样品,添加正构烷标准数据文件。



编辑相应合适的方法并保持。





应用所有样品或选用样品,分析样品。(建立新分析,添加样品数据,方法建立编辑,运行分析,分析结果处理等具体详细步骤可以参考前面的第一篇原创文章。)



核对正构烷结果。删掉溶剂,杂峰,柱流失峰等无关峰,点击右键,选Delete Compounds/Hit,删掉不必要的峰。



也选择Show Alternate hits...



选择合适的匹配正构烷。Set Best Hit。



把所有正构烷进行检查,并更换为正确的碳数。



点击右键,Export...,导出数据分析结果。





得到鉴定核对的正构烷表(scv格式)。

[img]" style="max-width: 100%;max-height: 100%;[/img]

把数据编辑为下列格式,保存为rtc或csv格式。

[img]" style="max-width: 100%;max-height: 100%;[/img]

如果从别的地方得到正构烷数据或已经有现成正构烷数据,也可以直接编辑成上面的格式。

2 未知样品数据处理,结果选用,保留指数结果核对

建立新分析或打开已有的分析,添加样品数据(经SBSE吸附搅拌磁子提取油烟样品,峰较多)。编辑合适的方法,这里使用NIST17谱库,如果有更专业的谱库,检索效果结果会更好。其中谱库检索下面的TR校正文件(RT Calibration file)添加前面已经编辑好的正构烷保留指数校正文件,如下图:



应用到所有样品或应用所选择样品,关闭close,保存方法。

右键点击Components的第一列,Add/Remove Column添加/移除列,添加Hit RI,Library RI库保留指数,这样在结果中就可以显示峰的计算保留指数和质谱库里的保留指数。也保存一下方法。



运行分析样品:



放大Components表



2.5949min的acetic acid,峰的计算保留指数为592,质谱库里的保留指数为610,在允许容忍范围,同时质谱图对比良好,可以确认此峰是乙酸。

对于9.411min的峰,选择Show Alternate hits...。

先添加library Retention Index和Target Retention Index列,以便对比保留指数结果。



选择alpha-Pinene,比较合适,然后set best hit确认,关闭窗口。



这样第二个峰就已经替换为alpha-Pinene 了。



同样10.817min,选beta-pinene。



11.1188是Twister流失的硅氧烷峰,可以删掉。

以此类推,删掉不需要的峰,确认或替换合适的化合物结果,如下图。



记住保存分析。如果需要可以导出分析结果(下面部分示例结果):

[img]" style="max-width: 100%;max-height: 100%;[/img]

全文完。
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symmacros
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yxwang1990
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最近刚好遇到此类问题,感谢朱老师分享,谢谢~
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原文由 yxwang1990(v3027539) 发表:
最近刚好遇到此类问题,感谢朱老师分享,谢谢~
我们也可以相互交流探讨一下。
罗亚檀香
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确实是最佳匹配的不一定就是该物质,还要结合保留时间或保留 指数加以判断。同样,匹配度不高,量小的(估计量太小,受到干扰影响大,从而影响匹配度),也不一定说明样品中未添加。这个我在解谱当中有遇到过,后来证实有加这个物质。从那之后,我一般匹配度,保留时间结合定性。
m3336169
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这个软件如果带有空白扣除就更好了。我说不是软件带的那种自动扣除空白,而是类似于色谱柱补偿这种。
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原文由 m3336169(m3336169) 发表:
这个软件如果带有空白扣除就更好了。我说不是软件带的那种自动扣除空白,而是类似于色谱柱补偿这种。
这个软件就是一般的背景扣除,没有类似色谱柱补偿这种。
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原文由 罗亚檀香(v2970225) 发表:
确实是最佳匹配的不一定就是该物质,还要结合保留时间或保留 指数加以判断。同样,匹配度不高,量小的(估计量太小,受到干扰影响大,从而影响匹配度),也不一定说明样品中未添加。这个我在解谱当中有遇到过,后来证实有加这个物质。从那之后,我一般匹配度,保留时间结合定性。
是的,不仅仅靠匹配度来判断,还有保留值来确认。匹配度有时候影响,会有干扰。
yy_0324
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深蓝
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接触安捷伦比较少,没想到还有这些功能。
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原文由 深蓝(mitsumi) 发表:
接触安捷伦比较少,没想到还有这些功能。
安捷伦软件功能不少,可惜这是会用一点点,有些根本没有资料,只好试试。