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目前主流的核酸提取方法有煮沸裂解法、苯酚氯仿抽提法、离心柱法、磁珠法，接下来介绍这几个方法的原理、优劣势及适用场景。
（1）煮沸裂解法：原理是通过加热使细胞膜破裂，充分暴露核酸，核酸可溶解于上层水溶液中，通过高速离心沉淀变性蛋白质和细胞碎片，上清液即为核酸粗提液。此方法的操作相对简单，成本低，但由于是粗提，成分比较复杂，有时可能带来一定的体系干扰或者裂解不充分的情况，一般用于细菌定性鉴定时使用。
（2）苯酚氯仿抽提法：原理是苯酚和氯仿抽提除去蛋白和多糖类杂质，获得相对较为纯净的基因组核酸。成本比较低廉。缺点是试剂毒性较大，长时间操作对人员健康有较大影响。试剂需要自行配制，批次间差异显著。提取效率相对较低，不适宜少量或者微量操作。一般用于大量核酸样本的抽提。
（3）离心柱法：原理是利用裂解液促使细胞破碎，使细胞中的核酸释放出来，利用柱子中的载体吸附提纯核酸。它的优点是比传统的酚氯法提取纯度高、毒性低，有利于RNA保护，而且能进行微量操作，价格较低。缺点是不便于高通量、自动化操作，对实验室设备和人员的操作技能要求较高。目前应用广泛，常用于细菌、病毒、动物组织等多种样本的核酸提取[13]。
（4）磁珠法：与离心柱的操作原理基本相同，利用交换吸附材料吸附核酸，从而将核酸和蛋白质等细胞中其他物质分离。优点是能够实现自动化、高通量操作，配合核酸自动提取仪使用，操作简单、用时短，核酸纯度高、浓度大，可广泛用应用于血液、动物组织、食品、病原微生物等样本中的DNA和RNA分离，但超高通量样本同时进行时，可能存在一定的污染风险。
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