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主题：【求助】请问：蛋白的拉曼谱图怎么扣除侧链基团的影响啊

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shuiyunmengze
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发表于：2008/03/02 16:46:21 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
悬赏金额：20积分 状态： 未解决

我是用拉曼做蛋白质的定量分析，不知道该怎么处理得到的谱图
有哪位用过Bejort的方法处理吗？
刚刚接触拉曼不久，对拉曼的数据处理不太懂，还请高手指教！谢谢！
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2008/3/12 19:19:45 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
做蛋白质定量分析，扣除侧链基团的影响？

在蛋白质的Raman谱中，侧链基团谱带主要由芳香族氨基酸侧链引起，如酪氨酸的850/830双峰，苯丙氨酸1002处一锐峰，半胱氨酸、蛋氨酸的CS峰，另外还有色氨酸吲哚环引起的谱峰等。

您是想扣除侧链基团的谱峰吗？不知您为何要这样做为何要扣除？您是想要哪些峰呢[多肽链骨架(酰胺I III，骨架CC)]？那不知您的定量分析是如何定量的，是通过峰强比呢还是峰面积比？还有，您使用的内标为何物(也就是您作比较的参考峰)？
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shuiyunmengze
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2008/3/13 18:46:39 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
因为想用蛋白的酰胺1和3键来做定量，怕会受到侧链的影响，所以想能不能扣除掉侧链的谱峰。
我也是刚接触拉曼，而且本来现在做定量的就不多，所以也是在摸索阶段。
想利用Bejort的方法做定量，他是用峰面积来做的，但是好像没有用内标。
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lh2000d
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2008/3/19 21:08:18 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
可能酰胺III较容易受影响，重叠较严重，可以考虑用酰胺I或其他峰。另外，可以选择亚甲基CH2在1448cm-1处的峰作为内标，此峰比较稳定；或者可以人为加入一种内标物质（其谱峰不与蛋白谱峰重叠）
对于您所说的Bejort方法，不知您参考的是、、、  没有了解过，也没查到，不是很清楚。

QQ55381948  可以进一步交流 探讨 相互学习
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