主题：【质谱参数解读--编号2】为什么离子阱采集谱图的快慢，不由扫描速度决定

中国人比较理解四极杆质谱，空间的嘛，离子从哪里产生，从哪里进，从哪里出，一看就明白。所以，常常推而论之，对于离子阱质谱，大家常常用四极杆的一些评价标准衡量。比如，我们这里说的扫描速度。这里，要谈的一个问题就是：离子阱采集谱图的快慢，不由扫描速度决定。
离子阱的一个scan cycle的时间（即我们通常理解的获得一张质谱图的时间，在离子流色谱图上，即意味着采集一个点的时间），是由以下几点因素决定的。
1-AGC 预扫描时间（大约为几十个毫秒，在Thermo的离子阱中，使用AGC技术，主要为了自动地预估阱内离子数多少，控制离子进入阱的那个“门”的大小，从而防止离子在离子阱中过载，因为过载后会引起空间电荷效应，带来谱图和线性的扭曲）
在Bruker和Agilent的离子阱中，使用ICC技术，是直接在离子注入离子阱的时候，一边注入，一边通过内插算法调节离子门大小，所以没有这个时间。
2-离子“注入”的时间（Inject time，这个时间是最长的，因此是速率决定步骤）
3-母离子分离和做MSn所需要的母离子激发的时间
4-把子离子依次扫描出离子阱的时间（这个时间由扫描速度决定，我们平时说的扫描速度在这里体现，即把离子从质量分析器逐出的速度）
完成一次scan cycle的真实情况见下图示意。




注：T＝Thermo；Ag＝Agilent；Br＝Bruker
AB的线性阱，具体参数不了解，但应该注入时间也大大减小。
通过以上分析，我们可以得知：不管是什么样的离子阱，只要速率决定步骤（即离子“注入”的时间）没有得到很大提高，扫描速度快慢与否，跟实际采集一个峰的点数关系并不大。这就好比开车从家到单位，从家到上高速前要堵40分钟，上了高速跑5分钟，下来再堵10分钟到单位。在高速上，即使开车速度提高1倍，对于整个行程时间的贡献也很小。瓶颈在从家到单位啊。
新型仪器二维线性阱之所以好，是因为“注入”时间Injection time，即决定速率的步骤，比所有的三维离子阱快很多，所以整个Scan Cycle的时间<200ms，跨越一个10 sec的色谱峰，可完成 > 50次的扫描。

好贴！
另外您能否再从技术上解释解释为什么二维肼的离子注入时间比三维肼短呢？