sslin回复于2006/01/12
1. 以下两种应该也有梯度场, 输入: gHSQC, gHMBC
2. 注意 以上两者所测 90 度脉冲是 H 而不是 C.
3. 另外, 有时可以考虑给仪器热身一下, 例如定 ss=32
rank回复于2006/08/23
很多时候取决于具体的样品吧。
以小蛋白为例,~10kDa, 1mM。
HSQC: 首先你要保证一维谱图足够清晰。nt>4, 一般你要保证s/n足够大。dsn会告诉你sn的值。我用的是500MHz, sn>70, 300MHz, sn=70*(300/500)^3/2. 对于溶剂峰,可以考虑用watergate除去。
j1xh可以去查,N-H ~95Hz, Ca-Ha 140Hz, 剩下的自己google一下吧。
混合时间=ni/sw1, 如果你需要indirect dimension很精确的话,就要设置ni比较大。 一般蛋白的混合时间〉10ms, 大蛋白由于驰豫的原因,混合时间更短。
拿到数据后,我一般用nmrPipe去处理,linux下的免费软件,很好用。通过zero filling 和 应用 window function, 可以有效的增加解析度。另外如果你只进行F1维FT变换,可以看到你在F2维,fid是否衰减到0。根据这个你可以决定增减ni.
原文由 xiangziholy 发表:
我的常用参数及步骤
COSY: 作氢谱,选好谱宽输入movesw,gCOSY,改ni=200or256,设定nt
NOESY:作氢谱,选好谱宽输入movesw,测90度脉冲,输入NOESY, ni=400, gain=38,nt?
HSQC:作氢谱,选好谱宽输入movesw,测90度脉冲,输入HSQC, ni=256, gain=38, d1=2, nt=?
HMBC: 作氢谱,选好谱宽输入movesw,测90度脉冲,输入HMBC, ni=400, gain=38, d1=2, nt=?