生物质谱,国内主要侧重于蛋白质/多肽及代谢组学。
代谢组学:
代谢物工具包括代谢物预测和代谢物检测两部分。代谢物预测模块可根据原药的结构和选定的可能代谢途径,自动预测可能的多代代谢物;代谢物检测与鉴定模块可以自动比较两个LC/MS测定结果在每个时间点的质谱数据之间的差异,并进行鉴定。该软件不仅可以用来监测代谢物,同时也可以用于药物或化合物产品的质量监控。通过相应软件将两组
LC-MS数据进行统计分析,从而找出两组数据之间具有统计学意义上的差异。具体功能包括:
LC-MS数据分段(分桶),主成份分析(PCA)包括试验数据组和交叉验证,储存、加载和输出;用户友好界面包括:相关联的显示样品表和数据桶表格、统计学图表、数据桶密度图,分组显示和放大图表等。
多目标筛查软件可用于自建目标化合物数据库,数据库包含了待测目标化合物的名称,分子式,准确分子量和保留时间。目标化合物数据库自动生成相应的数据处理方法和流程,全自动地提取并识别目标化合物的
离子色谱图,同时目标化合物的鉴定通过质量准确度,同位素分布模式和保留时间三重信息的确认来完成。可明显缩短复杂样品的测试分析时间。可在没有数据库的情况下,对LC/MS中的所有组分进行分子式自动预测。
蛋白质组学:
通过分析蛋白/多肽的质谱数据从而鉴定和表征蛋白质的工具,可用于数据库检索、蛋白翻译后修饰和蛋白变异位点的鉴定和确认和未知多肽从头测序,支持各种top-down分析技术获得的数据的标释和数据库检索。
包括海量数据的筛选方法和对单个或者少量蛋白质深入研究,如蛋白质修饰、蛋白质多样性或者拼接变异体。并且对布鲁克独特的WARP技术中起重要作用。
在通过数据库比对的全自动蛋白质鉴定中的特色:
用MALDI-TOF指纹图谱,PSD和
LC-MS/MS数据,实现全自动的蛋白质鉴定
用模糊逻辑判定搜库结果
批处理结果报告,包括可视化MALDI-TOF结果
支持从头序列分析
在蛋白质精细结构解析方面的特色:
MS和MS/MS数据的无缝连接,以及在线数据库检索
自动对MS和MS/MS图片进行注解
对交叉连接和修饰的完全支持
翻译后修饰的筛选工具
蛋白质精细结构表征
支持MS-BLAST同源性搜索
提供多肽的部分氨基酸序列信息,用于未知多肽从头测序分析,为同源性搜索如MS-BLAST提供序列标签,从而达到鉴定蛋白的目的。