主题：【求助】目前质谱分析软件有哪些？有相关学习教程吗？

不同厂家的仪器有不同的分析软件，而且操作方法都不一样。
搂主问这个问题问的，你做哪个型号的仪器呢

买了仪器就有相关软件，也有相关的操作培训的

原文由 yuduoling(yuduoling) 发表:
买了仪器就有相关软件，也有相关的操作培训的

这个应该是买的时候看你买哪些软件吧，至于相关的操作培训，软件分析好像很多都没有免费的培训，只有一些资料，其余都是收费的。

软件啊，尤其是数据库还需要收费？
生物质谱方面的数据库成熟么

原文由 无机麦地(shuiyang88) 发表:
软件啊，尤其是数据库还需要收费？
生物质谱方面的数据库成熟么

软件可是很多公司或者仪器的一大卖点呢，不过没看到有生物质谱方面成熟的数据库。

没有成熟的数据库是如何进行数据处理的/。

各种不同类型的质谱针对的操作软件都是不一样的

生物质谱，国内主要侧重于蛋白质/多肽及代谢组学。
代谢组学：
代谢物工具包括代谢物预测和代谢物检测两部分。代谢物预测模块可根据原药的结构和选定的可能代谢途径，自动预测可能的多代代谢物；代谢物检测与鉴定模块可以自动比较两个LC/MS测定结果在每个时间点的质谱数据之间的差异，并进行鉴定。该软件不仅可以用来监测代谢物，同时也可以用于药物或化合物产品的质量监控。通过相应软件将两组LC-MS数据进行统计分析，从而找出两组数据之间具有统计学意义上的差异。具体功能包括：LC-MS数据分段（分桶），主成份分析（PCA)包括试验数据组和交叉验证，储存、加载和输出；用户友好界面包括：相关联的显示样品表和数据桶表格、统计学图表、数据桶密度图，分组显示和放大图表等。
多目标筛查软件可用于自建目标化合物数据库，数据库包含了待测目标化合物的名称，分子式，准确分子量和保留时间。目标化合物数据库自动生成相应的数据处理方法和流程，全自动地提取并识别目标化合物的离子色谱图，同时目标化合物的鉴定通过质量准确度，同位素分布模式和保留时间三重信息的确认来完成。可明显缩短复杂样品的测试分析时间。可在没有数据库的情况下，对LC/MS中的所有组分进行分子式自动预测。

蛋白质组学：
通过分析蛋白/多肽的质谱数据从而鉴定和表征蛋白质的工具，可用于数据库检索、蛋白翻译后修饰和蛋白变异位点的鉴定和确认和未知多肽从头测序，支持各种top-down分析技术获得的数据的标释和数据库检索。
包括海量数据的筛选方法和对单个或者少量蛋白质深入研究，如蛋白质修饰、蛋白质多样性或者拼接变异体。并且对布鲁克独特的WARP技术中起重要作用。

在通过数据库比对的全自动蛋白质鉴定中的特色：
用MALDI-TOF指纹图谱，PSD和LC-MS/MS数据，实现全自动的蛋白质鉴定
用模糊逻辑判定搜库结果
批处理结果报告，包括可视化MALDI-TOF结果
支持从头序列分析

在蛋白质精细结构解析方面的特色：
MS和MS/MS数据的无缝连接，以及在线数据库检索
自动对MS和MS/MS图片进行注解
对交叉连接和修饰的完全支持
翻译后修饰的筛选工具
蛋白质精细结构表征
支持MS-BLAST同源性搜索

提供多肽的部分氨基酸序列信息，用于未知多肽从头测序分析，为同源性搜索如MS-BLAST提供序列标签，从而达到鉴定蛋白的目的。

国内国际上目前不少人在做这方面的工作。其实质谱也好，色质联用也好，都是很强大的硬件平台，根据各自的需要，通过可行的原理结合IT或者信息处理技术，可以DIY一定的应用方案出来的。目前比较给力的是在质谱平台上开发出来的微生物鉴定应用，不考虑国情等其他因素，这方面的市场还是很巨大的。