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主题：【分享】【文献搜索技巧】如何搜Pubmed时让低分文章走开？

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adayu

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发表于：2015/11/03 12:07:34 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

内容是转来的，分享给大家，希望能够有所帮助！
首先你要打开PubMed，最近PubMed很抽风，所以……我打不开……
这时候，我想起了曾说过的浏览器：天行浏览器（直接可以“全局代理”）。好吧，我试了一下，这速度一个快啊……

我们进去PubMed之后，要做的第一件事情就是，先注册……妈蛋，又要注册，最讨厌这种外国网站需要注册的了！就是先点这个“SIGN In To NCBI”。

好了，我们点进去了，你要是已经注册的话，就直接登录，要是没有注册的话，就按照提示注册一个账号就行了。（点击“Register for an NCBI account”）

注册完，回到PubMed的网页，我们会发现，右上角有一个“Manage Filters”。对了，就是这个，点进去：

创建一个新的Filter，也就是要你输入一个筛选条件。

如何搜10分以上的文章吧，真的是要你一个个手写输入的话，真的是要人命了。那怎么办？凉拌呗，这时候就需要一个影响因子的Excel表格了。但是，下载到表格后，就需要先把所有列，选择一个“筛选”项，就像这样：

然后在影响因子这一栏首行的下拉菜单中，选择“升序”，就像这样：

按照升序排列之后呢，找出所有的10分以上的影响因子，标记成黄色背景，这样：

然后，让我们回到筛选项。按颜色选择，就只选择黄色背景的。对，就这么任性，这样，右侧的杂志名称这一列，就全都是十分以上的杂志了，就像这样：

然后把所有十分以上的文章复制下来，打开个WORD文档，选择性粘贴上去，记得贴上去的是无格式的文本。

接着是放大招的时候，在Word上点击Ctrl+H，替换一下，把^p(就是回车键)替换成“ or”,记住引号也要加上啊，就像下面这样：

全部替换好之后，将末端的OR“删掉，在最前端加上”，这样大功告成了，特技加载完毕：

把加完特技的这些杂志名称，贴到Filter的那个创建的窗口里去，加个名字“IF>10”确定保存。

这样，我们再回到PubMed上进行搜索，就随便搜个Lnc RNA（HOTAIR）吧。于是可以发现，右上角出现了All(147),IF>10(8),也就是说，影响因子大于十的，有8篇，点一下，就进去了。

大家这下应该会了吧？
这时候，如果你想知道出现频率最高的词是什么？通过这些高频词，来分析最近研究的热点。那这要怎么做呢？
举个简单的例子，我们先去PubMed上搜一个关键词，比如MiRNA。当然，用上面的方法，就直接把这个调整到10分以上的文章，时间调整至一年以内，文章选好了。

接着就要选择显示这些文章的摘要了，点击Abstract（Text）就可以显示所有的摘要了。

获得摘要后，把它们复制到txt文件中，除了题目和摘要其他全部删除。

然后打开我心爱的神器，词频检索工具。

不过先要启用宏，并且联网才行。

然后点击按钮选择txt文件，但是不能选择所有的词性哦，英文的这个不能定词性的。

好了，接着就导入你要的txt文档。确定就可以分析了。

结果中会有大量的介词和一些没啥用的词，一眼就可以看出来，词频在前100的，基本上就是10分以上文章里最热点的东西了，你明白了么？

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2015/11/3 14:07:35 沙发管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

如何用PubReMiner来检索Pubmed
PubReMiner（http://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi），就这个网页：

用这个网页来搜的话，有一点要求，就是需要搜多个关键词。比如，我们来搜一个：“LncRNA”、“circRNA” ，这两个最近比较火吧。最大分析量只有10000篇，所以如果关键词太少，会导致无法显示分析。

好了点击一下“Start PubReMiner”就可以搜索了，搜索出来的结果会是这样的：

里面包括了高频作者，呃，也就可能是在这个领域研究的比较多的潜在大牛。接着是高频词和高频Mesh主题词。这两个其实是比较有用的，可以一目了然地发现，这些文献可能的研究的方向和科研的动态。然后通过对摘要搜索，也会显示出一些可能的相关底物。这其实也很有价值，这俩分子相关的一些研究的其他物质，也会显示出来了。还有一些其他信息，比如，研究这个的主要是印度人……
然后，大家既然看到有这样的主题词前，是有多选的框的，点上你想要的选项，选择“Search Again”。