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主题：【讨论】关于NIST谱库的检索方式

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chenlin_xy

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发表于：2022/07/28 09:09:20 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

NIST谱库的检索方式
1.AMDIS检索，谱库格式为*.MSL；
2.NIST MS Search检索，可选用库：mainlib、replib、nist_ri、nist_msms和nist_msms2；
3.应用安捷伦Chemstation工作站进行PBM检索，数据库格式为*.L；
4.采用AnalyzerPro等软件进行定性检索，可选用库：mainlib、replib、nist_ri、nist_msms和nist_msms2。

由于使用的谱库包括的化合物条目数量不同，以及检索参数设置存在细节差异，对同一谱图可定性出的化合物数量有很大差别。
阅读了symmacros版主发表的主题：【第十四届原创】AMDIS初步应用 (19) –如何利用Nist Search的结果弥补数据库局限性
https://bbs.instrument.com.cn/topic/7907796_2?order=threadid

问题1：应用AMDIS（谱库：NISTFF.MSL）在数量上远多于NIST MS Search检索（谱库：mainlib）可定性出的化合物数量。若NIST主库：mainlib已包括
NISTFF.MSL的化合物条目，为何有这么大的数量差异？

问题2：根据正构烷烃可计算出图谱各化合物的保留指数，为何设定的色谱条件检测正构烷烃（C7-C30），结果定性出C9-C24正构烷烃。应用该保留指数校正文件，为何在AMDIS中中也能自动计算出谱图中C9之前化合物中保留指数？

问题3：用AMDIS自动计算获得各化合物的保留指数，随后可在NIST MS Search中手工搜索该化合物的保留指数，再根据保留指数差异（如小于20）对化合物进行确认。然而有无对化合物保留指数与NIST谱库提供的保留指数进行批量自动化比较的方法？在AMDIS中又该如何设置和使用谱库nist_ri提供的保留指数信息？

上述问题欢迎大家交流探讨，不吝赐教！

该帖子作者被版主 检测人王大锤加 30积分， 2经验，加分理由：发帖

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2022/10/3 12:55:32 沙发管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

哇，最近也在头痛这个问题。我是用MassHunter Unknown Analysis，Nist 2020， Library RI 部分会有显示，但是只有非极性柱。我自己做了一个小Library，放的是indonwax的 RI，在Masshunter里检索却显示不出来。有人知道为什么吗？

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lijing320323

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2022/10/3 23:11:03 板凳管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

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symmacros

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2022/10/4 10:39:02 马扎管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原文由SkytheSg(Ins_43cfdd6d)发表:哇，最近也在头痛这个问题。我是用MassHunter Unknown Analysis，Nist 2020， Library RI 部分会有显示，但是只有非极性柱。我自己做了一个小Library，放的是indonwax的 RI，在Masshunter里检索却显示不出来。有人知道为什么吗？

请问你放在library的什么地方？是masshunter的格式还是chemstation格式？

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symmacros

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2022/10/5 9:25:05 地毯管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

问题1：应用AMDIS（谱库：NISTFF.MSL）在数量上远多于NIST MS Search检索（谱库：mainlib）可定性出的化合物数量。若NIST主库：mainlib已包括
NISTFF.MSL的化合物条目，为何有这么大的数量差异？
可能是MSL格式库优先，格式偏向，检索效果好，NIST格式差，可以考虑把NIST格式转换成MSL格式应用。我回头仔细看一下原因，再回答这个问题，假期没有带电脑。

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