主题:【第二届网络大赛参赛作品】···重磅出击,再谈“基质效应”··讨论升级,欢迎参与···

浏览0 回复202 电梯直达
MandyCheng
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这几天正在研究串联质谱方法分析生物样品的方法验证步骤。现在有两个概念我有些confused,一个是ion suppression,一个是interference。在Cleveland Clinic,其方法验证的步骤包括了ion suppression,分exogenous 和endogenous,有不同的评价方法;还包括interference,也分为这两种。请问LZ,exogenous主要指的什么?您认为应该用什么样的方法评价这两种不同类型的ion suppression呢?谢谢!
MandyCheng
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原文由 dickwang2008(dickwang2008) 发表:
原文由 bongyi 发表:
一直想请教楼主个问题,像分析那些蛋白结合率较高的物质,如果采用沉蛋白的方法处理样本,会不会有一定比例的待测物质随蛋白一起被沉淀,一般情况下比例会有多少,同一物质这个比例会比较稳定吗?



个人认为待测物质不会随蛋白一起被沉淀,这是由蛋白沉淀的原理决定的。因为沉淀蛋白是利用沉淀试剂如甲醇、乙腈或者高氯酸等将蛋白变性,形成沉淀,而化合物会溶解到沉淀试剂中。这种方法可能会将一些内源性物质带入到沉淀试剂中,产生基质效应。


怎样才能判断蛋白沉淀的完全不完全呢?
dickwang2008
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原文由 MandyCheng(gtyt1324) 发表:
这几天正在研究串联质谱方法分析生物样品的方法验证步骤。现在有两个概念我有些confused,一个是ion suppression,一个是interference。在Cleveland Clinic,其方法验证的步骤包括了ion suppression,分exogenous 和endogenous,有不同的评价方法;还包括interference,也分为这两种。请问LZ,exogenous主要指的什么?您认为应该用什么样的方法评价这两种不同类型的ion suppression呢?谢谢!


这个问题提问的很好,我先考虑一下,再回答你的问题。

另,这位版友能将你看的这篇文献共享一下吗?传上来大家都阅读一下,谢谢。
dickwang2008
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原文由 MandyCheng(gtyt1324) 发表:
原文由 dickwang2008(dickwang2008) 发表:
原文由 bongyi 发表:
一直想请教楼主个问题,像分析那些蛋白结合率较高的物质,如果采用沉蛋白的方法处理样本,会不会有一定比例的待测物质随蛋白一起被沉淀,一般情况下比例会有多少,同一物质这个比例会比较稳定吗?



个人认为待测物质不会随蛋白一起被沉淀,这是由蛋白沉淀的原理决定的。因为沉淀蛋白是利用沉淀试剂如甲醇、乙腈或者高氯酸等将蛋白变性,形成沉淀,而化合物会溶解到沉淀试剂中。这种方法可能会将一些内源性物质带入到沉淀试剂中,产生基质效应。


怎样才能判断蛋白沉淀的完全不完全呢?


如果蛋白沉淀不完全,那么在方法学确证中标准曲线的线性就会很差,或者说QC的结果不满足要求。
happy水中月
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原文由 dickwang2008(dickwang2008) 发表:
原文由 lianlxh 发表:
简直就是一篇完整的论文,发在这里说句实在话,有点可惜了


月姐姐认为应该发在哪呢?这就是在前辈的工作基础上,加入了个人的一些实例。

在深入讨论下,加点实验的验证可以发到有关的杂志上
MandyCheng
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我是在Cleveland Clinic看到的他们临床化学实验室关于方法验证的步骤,因为他们没有给我电子版的,我有空的时候会把他们的做法贴上来,希望跟LZ探讨一下。
阿宝
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写的不错,很详细,对液质不是很懂。Q-Trap作为串联质谱的一类,优势是什么?
dickwang2008
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原文由 MandyCheng(gtyt1324) 发表:
我是在Cleveland Clinic看到的他们临床化学实验室关于方法验证的步骤,因为他们没有给我电子版的,我有空的时候会把他们的做法贴上来,希望跟LZ探讨一下。



好的,没有问题。我们在日常试验中只考察内源性物质的干扰。期待你的回帖。
dickwang2008
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原文由 阿宝(lpr20) 发表:
写的不错,很详细,对液质不是很懂。Q-Trap作为串联质谱的一类,优势是什么?


阿宝版主来啦,Q-trap的优势是既可以定量,也可以定性。
MandyCheng
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以下是Cleveland Clinic关于串联质谱方法验证程序中的相关内容,请LZ和各位朋友看一下,我还会将他们发表的文章相关做法贴出来,看看到底是怎么回事。有机会我也会和这里的专家请教一下,确实有点糊涂。不过请大家原谅,因为我手头没有电子版的,只能暂时先把关于ion suppression和interference部分自己type出来,供大家讨论。
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