主题:【求助】谁知道7890A 5975C气质的SIM功能检测16种PAHs的具体使用方法呢

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holmes8519
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刚刚接触气质,不是很熟悉这个SIM(选择离子扫描)功能。昨晚尝试着使用这种方法做PAHs,但一直不能成功。

昨天使用的是PAHs 的标样,色谱条件:柱温90℃,8℃/min升温至180℃,15℃/min升温至280℃,保持12min,进样量0.2微升,分流比10:1.

最初先进行scan,找到了大概8种物质的出峰时间,然后选择那个SIM功能。

想问一下,
1、是要对那16种物质,每种物质都是单独的一个组么?还是16种物质在同一个组?
我是将16种物质分成了约12组,因为有几种物质的primary ion 和second ions 是相同的。结果出了一些峰,但对这些峰进行谱库检索的时候,发现不是之前的物质。

2、那个开始的时间,是依据scan的结果来确定的么?譬如scan的时候,萘的出峰时间大概是8.5min,那么,在SIM设置的时候,是不是也要设置在8.5min呢?
如果要依据scan的结果判断的话,scan结果中寻找一些峰不是很清晰,那应当怎么办呢?
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symmacros
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1、是要对那16种物质,每种物质都是单独的一个组么?还是16种物质在同一个组?
我是将16种物质分成了约12组,因为有几种物质的primary ion 和second ions 是相同的。结果出了一些峰,但对这些峰进行谱库检索的时候,发现不是之前的物质。

可以把相同选择离子的相近的化合物放在一组。SIM检索不一定能得到好的匹配结果。
symmacros
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2、那个开始的时间,是依据scan的结果来确定的么?譬如scan的时候,萘的出峰时间大概是8.5min,那么,在SIM设置的时候,是不是也要设置在8.5min呢?
如果要依据scan的结果判断的话,scan结果中寻找一些峰不是很清晰,那应当怎么办呢?

可以根据Scan的结果来确定扫描的开始和结束时间。萘的出峰时间大概是8.5min,哪开始扫描的时间至少在峰未出来前开始,即少于8.5min。

scan结果中寻找一些峰不是很清晰,请问是指匹配度不好还是什么?
砂锅粥
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SIM的结果做谱库检索比对是没什么意义的,因为SIM是提取了几个特征离子(一般3个左右),而谱库的结果是scan的(全扫描,所有离子都扫描),所以SIM结果匹配度不高是很正常的。
holmes8519
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SIM的结果做谱库检索比对是没什么意义的,因为SIM是提取了几个特征离子(一般3个左右),而谱库的结果是scan的(全扫描,所有离子都扫描),所以SIM结果匹配度不高是很正常的。


哈哈,可能就是这种原因,谢谢!
holmes8519
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2、那个开始的时间,是依据scan的结果来确定的么?譬如scan的时候,萘的出峰时间大概是8.5min,那么,在SIM设置的时候,是不是也要设置在8.5min呢?
如果要依据scan的结果判断的话,scan结果中寻找一些峰不是很清晰,那应当怎么办呢?

可以根据Scan的结果来确定扫描的开始和结束时间。萘的出峰时间大概是8.5min,哪开始扫描的时间至少在峰未出来前开始,即少于8.5min。

scan结果中寻找一些峰不是很清晰,请问是指匹配度不好还是什么?


scan的结果,看不出来具体的峰,可能是峰比较小,而后面一些分子量较大的PAHs,出来的时候,已经被升高的基线所掩盖了,使用“GC-MS Data analysis”软件的“chromatography”菜单中的“extract ion chromatography”功能,提取的离子,进行谱库检索,其匹配度非常低
symmacros
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SIM的结果做谱库检索比对是没什么意义的,因为SIM是提取了几个特征离子(一般3个左右),而谱库的结果是scan的(全扫描,所有离子都扫描),所以SIM结果匹配度不高是很正常的。


哈哈,可能就是这种原因,谢谢!


SIM结果检索只是非常粗的参考。
symmacros
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2、那个开始的时间,是依据scan的结果来确定的么?譬如scan的时候,萘的出峰时间大概是8.5min,那么,在SIM设置的时候,是不是也要设置在8.5min呢?
如果要依据scan的结果判断的话,scan结果中寻找一些峰不是很清晰,那应当怎么办呢?

可以根据Scan的结果来确定扫描的开始和结束时间。萘的出峰时间大概是8.5min,哪开始扫描的时间至少在峰未出来前开始,即少于8.5min。

scan结果中寻找一些峰不是很清晰,请问是指匹配度不好还是什么?


scan的结果,看不出来具体的峰,可能是峰比较小,而后面一些分子量较大的PAHs,出来的时候,已经被升高的基线所掩盖了,使用“GC-MS Data analysis”软件的“chromatography”菜单中的“extract ion chromatography”功能,提取的离子,进行谱库检索,其匹配度非常低


是完全有可能的,后段基线上升有干扰。
砂锅粥
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2、那个开始的时间,是依据scan的结果来确定的么?譬如scan的时候,萘的出峰时间大概是8.5min,那么,在SIM设置的时候,是不是也要设置在8.5min呢?
如果要依据scan的结果判断的话,scan结果中寻找一些峰不是很清晰,那应当怎么办呢?

可以根据Scan的结果来确定扫描的开始和结束时间。萘的出峰时间大概是8.5min,哪开始扫描的时间至少在峰未出来前开始,即少于8.5min。

scan结果中寻找一些峰不是很清晰,请问是指匹配度不好还是什么?


scan的结果,看不出来具体的峰,可能是峰比较小,而后面一些分子量较大的PAHs,出来的时候,已经被升高的基线所掩盖了,使用“GC-MS Data analysis”软件的“chromatography”菜单中的“extract ion chromatography”功能,提取的离子,进行谱库检索,其匹配度非常低
楼主进行谱库检索的时候有没有扣除基线呢?
symmacros
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2、那个开始的时间,是依据scan的结果来确定的么?譬如scan的时候,萘的出峰时间大概是8.5min,那么,在SIM设置的时候,是不是也要设置在8.5min呢?
如果要依据scan的结果判断的话,scan结果中寻找一些峰不是很清晰,那应当怎么办呢?

可以根据Scan的结果来确定扫描的开始和结束时间。萘的出峰时间大概是8.5min,哪开始扫描的时间至少在峰未出来前开始,即少于8.5min。

scan结果中寻找一些峰不是很清晰,请问是指匹配度不好还是什么?


scan的结果,看不出来具体的峰,可能是峰比较小,而后面一些分子量较大的PAHs,出来的时候,已经被升高的基线所掩盖了,使用“GC-MS Data analysis”软件的“chromatography”菜单中的“extract ion chromatography”功能,提取的离子,进行谱库检索,其匹配度非常低
楼主进行谱库检索的时候有没有扣除基线呢?


估计基线的位置很高,有可能遮盖目标物了,比较难扣。
砂锅粥
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2、那个开始的时间,是依据scan的结果来确定的么?譬如scan的时候,萘的出峰时间大概是8.5min,那么,在SIM设置的时候,是不是也要设置在8.5min呢?
如果要依据scan的结果判断的话,scan结果中寻找一些峰不是很清晰,那应当怎么办呢?

可以根据Scan的结果来确定扫描的开始和结束时间。萘的出峰时间大概是8.5min,哪开始扫描的时间至少在峰未出来前开始,即少于8.5min。

scan结果中寻找一些峰不是很清晰,请问是指匹配度不好还是什么?


scan的结果,看不出来具体的峰,可能是峰比较小,而后面一些分子量较大的PAHs,出来的时候,已经被升高的基线所掩盖了,使用“GC-MS Data analysis”软件的“chromatography”菜单中的“extract ion chromatography”功能,提取的离子,进行谱库检索,其匹配度非常低
楼主进行谱库检索的时候有没有扣除基线呢?


估计基线的位置很高,有可能遮盖目标物了,比较难扣。
我感觉如若目标化合物的信噪比足够高的话,扣不扣基线噪音结果影响不大,但是如果信噪比比较小的话,扣和不扣检索结果可能是完全不同的。不知大家有没有同感?
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