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液质联用（LCMS）
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主题：【已应助】【求助】弱问LCQ AD MAX液质联用的主要应用范围

浏览0 回复6 电梯直达
xiaoxixu
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发表于：2007/03/05 10:27:00 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
如题，谢谢！
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liang_sp
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2007/3/5 11:51:00 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
三者都是Thermo的仪器品牌。
LCQ是例子井的仪器，用于定性分析的较多。
AD TSQ用于定量分析，性价比高。
MAX是离子源不是仪器型号。
比AD高一级的有Ultra
Good luck！
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xiaoxixu
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2007/3/5 14:16:00 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我们仪器的型号就是LCQ Advantage MAX LC－MS，在性能方面可能不如LCQ Deca XP，TSQ等，我想了解一下这种类型的仪器在蛋白质，肽或核酸方面应用如何？谢谢！
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Hankison
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2007/3/7 16:35:00 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
LCQ AD Max的灵敏度和质荷比范围要比热电其他离子阱型号的液质差一些，应该说功能上差不多，关键就是看灵敏度和质量范围。要是有钱，做蛋白用线性离子阱或者Q-tof，FT什么的会更好。
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crazycat
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2007/3/7 22:48:00 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 xiaoxixu 发表:
我们仪器的型号就是LCQ Advantage MAX LC－MS，在性能方面可能不如LCQ Deca XP，TSQ等，我想了解一下这种类型的仪器在蛋白质，肽或核酸方面应用如何？谢谢！


LCQ Advantage和Deca在实际使用上的感受差别就是：DecaXP灵敏度要高大约10~20倍。其它就差不多了。
要是做大分子呢，
（1）一种是直接测一下分子量，但是会要求脱盐干净，而且会有很多多电荷峰。这时真正确定分子量，你需要一个热电的Mass Deconvolution去卷积的软件，才能真正算出分子量。但这个软件很贵。如果你没有这个软件，你可以去热电网上download一个3个月的限时版，或者更有水平的话，去google搜索分子量计算的一些软件（我相信有，并且有接受LCQ Raw文件格式的）。

（2）另外一种是测定肽，而不是整个蛋白。这时可以用二级质谱打碎，然后测定序列。还可以用一个热电的Bioworks的软件，但同样很贵。你同样可以把数据传到Masscot网上，去得到匹配的蛋白或肽的结果。

总之呢，做大分子，一定要脱盐。脱盐的最好方法其实就是过反相柱。

ng级别的还是能测定的，我认为调节得好，LCQ AD可以到几百个pg左右。

最后，所有你查到的关于LCQ在蛋白、肽等大分子方面的文献，都可以实践。AD和Deca在使用上只有灵敏度的差异。另外，这套仪器很皮实，尽得起你折腾。这可能是热电最皮实的一台仪器了。

good luck!
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无声潜伏
wang_ruyi
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2013/3/26 12:24:59 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 crazycat(crazycat) 发表:
原文由 xiaoxixu 发表:
我们仪器的型号就是LCQ Advantage MAX LC－MS，在性能方面可能不如LCQ Deca XP，TSQ等，我想了解一下这种类型的仪器在蛋白质，肽或核酸方面应用如何？谢谢！


LCQ Advantage和Deca在实际使用上的感受差别就是：DecaXP灵敏度要高大约10~20倍。其它就差不多了。
要是做大分子呢，
（1）一种是直接测一下分子量，但是会要求脱盐干净，而且会有很多多电荷峰。这时真正确定分子量，你需要一个热电的Mass Deconvolution去卷积的软件，才能真正算出分子量。但这个软件很贵。如果你没有这个软件，你可以去热电网上download一个3个月的限时版，或者更有水平的话，去google搜索分子量计算的一些软件（我相信有，并且有接受LCQ Raw文件格式的）。

（2）另外一种是测定肽，而不是整个蛋白。这时可以用二级质谱打碎，然后测定序列。还可以用一个热电的Bioworks的软件，但同样很贵。你同样可以把数据传到Masscot网上，去得到匹配的蛋白或肽的结果。

总之呢，做大分子，一定要脱盐。脱盐的最好方法其实就是过反相柱。

ng级别的还是能测定的，我认为调节得好，LCQ AD可以到几百个pg左右。

最后，所有你查到的关于LCQ在蛋白、肽等大分子方面的文献，都可以实践。AD和Deca在使用上只有灵敏度的差异。另外，这套仪器很皮实，尽得起你折腾。这可能是热电最皮实的一台仪器了。

good luck!


楼上说的太有价值了，我最近有两个朋友都想用LCQ来做核苷酸，说通过文献查出来发现它做大分子比Q-TOF的还要准确，和理论分子量非常接近。是不是有一种软件来推算出分子量？这个是什么软件？按理说LCQ质核比只能做到2000还是3000吧，具体忘了，但一万以上肯定不行，不知道是通过什么方法来实现的，而且居然比TOF还要准确？
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yzulcl
yzulcl
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2013/4/9 16:41:12 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我们实验室有热电的 LCQ Deca XP max 和布鲁克的 maXis ，正好一个是离子阱一个是Q-TOF。做过蛋白的分子量测定，无论从理论上来说还是从实际实验的结果来看，Q-TOF完胜离子阱。

关于质荷比的问题：LCQ Deca XP 可以选择50-2000或者200-4000；Q-TOF由于Q的限制，一般质荷比上限也就在三四千；应该说质荷比范围差不多。一般做蛋白分子量用的离子源都是ESI，这样的质荷比范围足够了，因为蛋白会形成多电荷。

分享一张文献上的图：
能做出这张图这么高的质荷比，仪器的离子传输以及质量分析器的参数应该是专门优化过了的，没准用的一些特别的硬件也说不定。

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2013/4/9 17:00:55 Last edit by yzulcl
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