主题：【分享】化合物亲水或疏水性的初步判定

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发表于：2024/10/25 13:40:59 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

方法开发基本功底，拿到化合物结构，能判定采用什么色谱柱和流动相中有机相的大概比例。这需要根据化合物的结构，对其亲水性或疏水性有一个“大概”的认识，可以不需要精准，如果有软件比如用ACD labs预测一下化合物的LogD值或logP值，那就更完美了。

A组：随着疏水基团的减少，亲水基团的增多，在水中的溶解度增大，在普通C18柱子上，保留越来越弱；（不考虑和硅羟基的作用）

B组：随着疏水基团的增多，在水中的溶解度降低，亲水性降低，疏水性增强，在普通C18柱子上，保留增强。

常见的离子对试剂，庚烷磺酸纳，辛烷磺酸纳，十二烷基硫酸纳或十二烷基磺酸纳，十六烷基三甲基溴化铵，随着碳链的延长，在C18色谱柱上保留越来越强，不容易洗脱下来，会残留在C18链上成为了烷基链的一部分，对色谱柱的改性越来越大，最终改变其他化合物的保留时间，所以只能专柱专用，且平衡时间久。

极性基团占比增多，亲水性增强，在普通C18柱上保留减弱，极性基团占比降低，疏水性增强，在普通C18柱上保留增强。常见的亲水性基团有：

含有这类基团的化合物，由于和水能形成氢键，具有溶于水或与水混合的性质，是否亲近水，还需要整体看化合物其他基团的亲水性。常见的疏水性基团如下：

案例1：

胡椒乙胺含有亲水性特别强的伯胺，还含有两个醚键，醚上的氧有孤对电子，能与水形成氢键，海含有憎水的苯环和较短的烷基链，整体看亲水还是比较强，如果成盐后，亲水性进一步加强，在常规的0.1%磷酸水溶液为流动相（C18）柱上，保留较弱；腺嘌呤，含有的亲水基团更多，相对于胡椒乙胺，其亲水性更强，保留更弱。
案例2：

A杂质含有羟基，B杂质含羰基，羟基亲水性大于羰基，A先出峰，B后出峰；四烯甲萘醌相对于杂质B，多了20个碳侧链，疏水性增强；

维生素E中的酯基和醚键虽然能和水形成氢键的特性，但是酯基和醚均被相邻甲基包围，位阻较大，整体疏水性很强；四烯甲萘醌的侧链有20个碳原子，维生素E侧链有16个碳原子，按照碳链越长，疏水性越大来说，四烯甲萘醌保留可能比维生素E更强，但是四烯甲萘醌结构中的两个羰基，基本不受相邻基团空间位阻影响，形成氢键的能力更强，综合看，相同条件下可能四烯甲萘醌出峰应该会比维生素E早，这个只是猜测。

想起21号收到了礼包“ACD/chemsketch Freeware”软件，立即下载了安装，预测结果如下，猜测符合预期。