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气路（氮气或氦气） | 对用NaOH流动相，用于保护流动相以免同空气接触。其它系统可以不用气路，用量少。 | 一般无，但ELSD和MS需要，用量大。 |
流路系统 | 全peek材料，耐强酸强碱和一般反相有机试剂 | 特殊金属材料为主，耐有机溶剂，不耐强酸强碱 |
流动相 | 以强酸强碱为主，兼反相系统，不能用于正相。流动相种类少 | 正反相系统兼离子交换。种类相对较多。 |
试剂要求 | 对去离子水要求极高，大于17.8mΩ,成本很高。有机试剂也要考虑离子杂质，至少HPLC级。 | 水要求相对较低，大于10 mΩ，成本不高。要求HPLC级试剂。 |
色谱柱 | 通用性较差，样品对柱子有很强的选择性，品牌少选择余地小，价格高。 | 通用性强，品牌多选择余地大，价格相对较低。 |
抑制器 | 有二种：单柱法（无） 和双柱法，灵敏度高 | 用电导时，测定阴离子可以需要。 |
检测器 | 以电导为主，可以用PAD、UV、FU、MS等 | 以紫外为主，其它的有FU、DAD、RI、PAD、ELSD、MS、ED等 |
分析对象 | 早期以阴离子为主，现可以分析无机、有机阴阳离子，也可分析极性的有机物，糖及生物大分子等。分子对象范围较小，以离子化合物为主。 | 可以分析部分无机物，但灵敏度低。以有机物为主，选择不同的柱子可以分子各种大小分子。分析对象范围大。 |
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