主题:【求助】有关用 bruker Daltonics 分析FT-ICR MS图的问题

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tjhgst
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各位大虾,本人做了个油的FT-ICR MS,听说用bruker Daltonics 软件可对该质谱数据进行分析,本人对软件学习了几天,但有几个问题仍不得其解,特诚向你们请教下:1、如何将软件窗口显示的质谱图导出并在在origin作图,且图和 Daltonics 软件一样,本人尝试了将其输出为ascii spectrum file的形式,然后导入到origin中作图,但做出的图与前者有差别(图请见附件);2、如何将 Daltonics 软件显示的局部放大的质谱图(见附件)也能在origin中做出来?3、如何用Daltonics 软件定性分析出质谱局部放大图中各个峰所代表化合物的分子式和结构式。谢谢啊!
                          因本人初上贵坛,故没有金币发放,以后有了一定补给啊!请见谅
附件:
推荐答案:phillyrin回复于2011/07/29


既然有数据,在绘图之后,将所有峰标出。然后以峰的信息绘制棒状图即可。


2、如何将 Daltonics 软件显示的局部放大的质谱图(见附件)也能在origin中做出来? 

调整originX,Y轴的范围即可作出


3、如何用Daltonics 软件定性分析出质谱局部放大图中各个峰所代表化合物的分子式和结构式。谢谢啊!
                     

这个没有用过,没有办法回答你,不过,FT-ICR既然是质谱,怎么也跳不出质谱分析的一般套路。所以请参考其他文献吧。
补充答案:

symmacros回复于2011/07/28

请问FT-ICR是什么意思?

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symmacros
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请问FT-ICR是什么意思?


FT_ICR :傅立叶变换 离子回旋共振

高端质谱啊,维护那么一个东东比维护核磁还麻烦……

眼下也就是布鲁克在做这个了。热电和安-瓦都不再做了。

坛子里面好像是有布鲁克的人的,你问问他们吧。
phillyrin
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1、如何将软件窗口显示的质谱图导出并在在origin作图,且图和 Daltonics 软件一样,本人尝试了将其输出为ascii spectrum file的形式,然后导入到origin中作图,但做出的图与前者有差别(图请见附件); 


既然有数据,在绘图之后,将所有峰标出。然后以峰的信息绘制棒状图即可。


2、如何将 Daltonics 软件显示的局部放大的质谱图(见附件)也能在origin中做出来? 

调整originX,Y轴的范围即可作出


3、如何用Daltonics 软件定性分析出质谱局部放大图中各个峰所代表化合物的分子式和结构式。谢谢啊!
                     

这个没有用过,没有办法回答你,不过,FT-ICR既然是质谱,怎么也跳不出质谱分析的一般套路。所以请参考其他文献吧。
该帖子作者被版主 jimzhu4积分, 2经验,加分理由:谢应助。
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2011/7/29 12:38:56 Last edit by phillyrin
symmacros
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请问FT-ICR是什么意思?


FT_ICR :傅立叶变换 离子回旋共振

高端质谱啊,维护那么一个东东比维护核磁还麻烦……

眼下也就是布鲁克在做这个了。热电和安-瓦都不再做了。

坛子里面好像是有布鲁克的人的,你问问他们吧。


谢谢,请问有什么优势或特点?
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请问FT-ICR是什么意思?


FT_ICR :傅立叶变换 离子回旋共振

高端质谱啊,维护那么一个东东比维护核磁还麻烦……

眼下也就是布鲁克在做这个了。热电和安-瓦都不再做了。

坛子里面好像是有布鲁克的人的,你问问他们吧。


谢谢,请问有什么优势或特点?


超高分辨啊,各种超高分辨,适合各种接口

色魔原来也做这个,后来自从搞出来orbitrap后,为了防止左右手互博,就把ICR停了。

orbitrap分辨能力不及ICR,但是高于TOF。

ICR的维护工作相当繁琐,各种加液氮,液氦。和折腾一个核磁没有什么区别,每年花在液氦上的钱就不少。但是提供的信息量远比核磁少多了。

大概原理就是液氦里面泡着一个超导磁体,磁场中心放一个小盒子,把各种离子化的离子注射到里面去,离子在洛伦兹力的作用下转圈。产生一个共振信号,经过一次傅立叶变换后,可以得到质谱信号了。单从外形上看,也很像是一个横着放的核磁。

http://www.thermoscientific.com/ecomm/servlet/productscatalog_11152_L10458_87171_-1_4

http://www.bdal.com/products/ftms/solarix/overview.html

http://www.chem.agilent.com/EN-US/PRODUCTS/INSTRUMENTS/MS/FT-MS/Pages/default.aspx
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2011/7/29 12:44:09 Last edit by phillyrin
LQQ单曲循环
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楼主您好!我想请教一下怎样将后缀名为spectrum的文件导入到origin里啊?最近也在做FT-MS的图,一直弄不好,太感谢您了!
LQQ单曲循环
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symmacros
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原文由 LQQ单曲循环(v2931016) 发表:
没有人答复 好伤心
楼主已经好久不来了,无法回你了。
LQQ单曲循环
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
楼主已经好久不来了,无法回你了。
嗯呢,看来得我自己继续摸索啦!谢谢你哦~
frozenthrone
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挖挖古墓帖。

Agilent 2008 Technical overview 5989-7409EN (http://www.doc88.com/p-6751806940986.html)
引用2006 Tobias Kind 文章Metabolomic database annotations via query of elemental compositions: Mass accuracy is insufficient even at less than 1 ppm
(https://core.ac.uk/download/pdf/81606563.pdf)中观点

高分辨质谱(TOF/Oritrap/FT-ICR)1ppm的质量精度不足以利用单个精确质量确定分子式,要辅以同位素峰才能确定。

未知物定性,元素种类还需要自行调整,说句实话,没有标准品和参考文献的逆向分析还是存在较大难度。
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