主题:【已应助】液质用于天然产物成分分析

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gzl861225
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有没有用液质联用的方法来分析天然产物成分的?我的问题是:没有标准品,如何确定未知物?光根据碎片真的能推导出化合物吗?期待高手指点
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dark_wzy
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这只能借助于高分辨质谱了,QTof之类的,不过需要比较好的植物化学或者有机化学的基础,否则反推结构的难度比较高。
zlbabomb
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高分辨质谱是肯定要做的了,当然也只能提供一个分子式,无法提供结构,如果你要进一步确认结构,但是你现在一个相关的标准品都没有的话,那肯定是推不出来的了。如果你有相关的标准品,那做多级断裂然后根据平移效应还是可以推出相关的结构的
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原文由 zlbabomb(zlbabomb) 发表:
高分辨质谱是肯定要做的了,当然也只能提供一个分子式,无法提供结构,如果你要进一步确认结构,但是你现在一个相关的标准品都没有的话,那肯定是推不出来的了。如果你有相关的标准品,那做多级断裂然后根据平移效应还是可以推出相关的结构的

请教一下什么叫做“平移效应”?
gzl861225
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原文由 dark_wzy(dark_wzy) 发表:
这只能借助于高分辨质谱了,QTof之类的,不过需要比较好的植物化学或者有机化学的基础,否则反推结构的难度比较高。

我植物化学和有机化学基础都不好
黑子
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原文由 gzl861225(gzl861225) 发表:
有没有用液质联用的方法来分析天然产物成分的?我的问题是:没有标准品,如何确定未知物?光根据碎片真的能推导出化合物吗?期待高手指点


二极管阵列检测器从吸收峰可以判别天然产物的大概类别,你心里有个轮廓,这类化合物主体结构大概是什么样的;离子阱质谱可以得到这个化合物的碎片信息,从这些碎片信息上再结合主体结构,你可以推测这个化合物的结构式。当然,如果你做的化合物刚好的前人做过的,你从n级的谱图上可以跟前人的谱图对的上,那从谱库里一检索,你就知道了化合物的结构式。如果你做的化合物别人没做过,你可以从MassFrontier里画出来你推测的结构式,这个软件可以根据根据结构式,自动计算断裂规律及碎片信息。这样,你再和你打出碎片信息对照,如果对照的上,就基本可以确定未知物了。如果不放心,你再买个这个化合物的标准品,再打一遍,看和你以前打的质谱图是不是一样的。

当然,如果你用的是高分辨质谱,能够得到母离子及碎片离子的精确质量数,那推测结构就会更准确一些。所以,我觉得LTQ-Orbitrap做这个工作是最合适的,但是太贵。不过,离子阱质谱是可以做这个工作的。不过,这项工作需要人的水平也比较高,给出了碎片信息,人推测不出来整体结构也是白搭。
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gzl861225
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原文由 黑子(aiwa54) 发表:
原文由 gzl861225(gzl861225) 发表:
有没有用液质联用的方法来分析天然产物成分的?我的问题是:没有标准品,如何确定未知物?光根据碎片真的能推导出化合物吗?期待高手指点


二极管阵列检测器从吸收峰可以判别天然产物的大概类别,你心里有个轮廓,这类化合物主体结构大概是什么样的;离子阱质谱可以得到这个化合物的碎片信息,从这些碎片信息上再结合主体结构,你可以推测这个化合物的结构式。当然,如果你做的化合物刚好的前人做过的,你从n级的谱图上可以跟前人的谱图对的上,那从谱库里一检索,你就知道了化合物的结构式。如果你做的化合物别人没做过,你可以从MassFrontier里画出来你推测的结构式,这个软件可以根据根据结构式,自动计算断裂规律及碎片信息。这样,你再和你打出碎片信息对照,如果对照的上,就基本可以确定未知物了。如果不放心,你再买个这个化合物的标准品,再打一遍,看和你以前打的质谱图是不是一样的。

当然,如果你用的是高分辨质谱,能够得到母离子及碎片离子的精确质量数,那推测结构就会更准确一些。所以,我觉得LTQ-Orbitrap做这个工作是最合适的,但是太贵。不过,离子阱质谱是可以做这个工作的。不过,这项工作需要人的水平也比较高,给出了碎片信息,人推测不出来整体结构也是白搭。

非常感谢,解释的很清楚
zlbabomb
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原文由 gzl861225(gzl861225) 发表:
原文由 zlbabomb(zlbabomb) 发表:
高分辨质谱是肯定要做的了,当然也只能提供一个分子式,无法提供结构,如果你要进一步确认结构,但是你现在一个相关的标准品都没有的话,那肯定是推不出来的了。如果你有相关的标准品,那做多级断裂然后根据平移效应还是可以推出相关的结构的

请教一下什么叫做“平移效应”?


额,很久没上论坛了,这个解释起来貌似比较麻烦。

打个比方吧,你现在有两个化合物,性质相似,其中一个你比较确定,有标准品对照,想推另外一个结构,那你做多级断裂的时候,第一步当然你要很清楚的推出已知化合物的断裂路径,然后比较两个断裂结果的相同点和不同点,相同说明取代基位置不在中性丢失的官能团上,不同说明取代基可能就在这里,其他位置都是相同,然后推结构,么有给出两个具体化合物说明问题可能比较抽象,不知道LZ听懂没
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