主题:【第七届原创】香精香料样品GCMS数据处理实例(1)

浏览0 回复89 电梯直达
symmacros
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现在处理数据,每次也会用amdis先处理一遍,再用工作站处理的时候,就可以随时参考amdis的结果,看看有没有漏掉的峰。
不过amsid的库和工作站的不能通用,建库是个很琐碎的事。


Amdis确实很好,但需要库配套,建库也是件辛苦之事。


有个amsid建库的问题,想请教朱老师

工作站检索发现了一个物质,在amdis中也能发现(一个倒三角,没有“T”)。

现在想建立一个此物质的库,但倒三角的峰和标准库中的不一致,多了一些无用的离子。

用此质谱图建库,显然不是此物质正确的质谱图。

请问此问题该如何解决?


没关系,加入库里的是经解卷积处理后的质谱图,不是这一点的原始质谱图。


不好意思,没说清楚,是:经解卷积处理后的质谱图,还是不准。多了无用的离子。


好像在library里面可以编辑离子。
symmacros
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原文由 侠客行008(v2811870) 发表:
强烈支持楼主的原创文章。
问个小白问题,什么是Amdis? 是Agilent MSD Chem中自带的功能吗?


AMDIS 软件由美国国家标准技术研究院(NIST)(National Institute of Standards and Technology)提供。
The Automatic Mass Spectral Deconvolution and Identification System (AMDIS)
自动质谱图解卷积和鉴定系统软件(AMDIS)让您从GC/MS数据文件自动找到目标化合物。软件先对GC/MS数据文件解卷积寻找所有分离组分。每一组分与目标化合物的谱库进行对比。如果以上的用户设定值,然后报告出目标图谱和解卷了组分的图谱的匹配因子。

什么是解卷积(Deconvolution)?
NIST AMDIS的定义:“这里所用的术语在广义上是指从一个复杂的混合物中提取信号。 解卷积的过程包括处理噪音、校正漂移、从紧密相邻的共洗脱峰中提取出单个峰等。” (简单讲就是去复杂化)

用下面的简图可以解释解卷积过程:
在GC/MS 中,Deconvolution是一种数学技术,它可以将重叠的质谱图“分开”成为“清晰”的单个组分的谱图。图1 是这个过程的简单示意图。这里分别是总离子流色谱图(TIC)和质谱图。与常见的情况一样,这个色谱峰包含了多个重叠在一起的组分,而最高点质谱图实际上也是这些组分的组合图。质谱谱库检索只可能给出一个较差的匹配,而且不能识别所有构成这种组合谱图的单个化合物组分。

Amdis可以单独免费下载或NIST库光盘也包含此软件。
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原文由 侠客行008(v2811870) 发表:
楼主这个是用什么公司的什么GC-MSD配置做出的啊?


Agilent6890/5975C就行。
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好像在library里面可以编辑离子。


今天看了下,确实可以编辑离子。方法如下:

library——library transfer,在弹出的对话框左侧,选中需要编辑的物质名称,选择“Edit”,——Spectrum,进入编辑模式。

可以对质谱图中的离子进行添加,删除,替换(包括其响应值)操作。



只用过一次,具体忘记了。谢谢上图。
symmacros
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问个小白问题,什么是Amdis? 是Agilent MSD Chem中自带的功能吗?


AMDIS 软件由美国国家标准技术研究院(NIST)(National Institute of Standards and Technology)提供。
The Automatic Mass Spectral Deconvolution and Identification System (AMDIS)
自动质谱图解卷积和鉴定系统软件(AMDIS)让您从GC/MS数据文件自动找到目标化合物。软件先对GC/MS数据文件解卷积寻找所有分离组分。每一组分与目标化合物的谱库进行对比。如果以上的用户设定值,然后报告出目标图谱和解卷了组分的图谱的匹配因子。

什么是解卷积(Deconvolution)?
NIST AMDIS的定义:“这里所用的术语在广义上是指从一个复杂的混合物中提取信号。 解卷积的过程包括处理噪音、校正漂移、从紧密相邻的共洗脱峰中提取出单个峰等。” (简单讲就是去复杂化)

用下面的简图可以解释解卷积过程:
在GC/MS 中,Deconvolution是一种数学技术,它可以将重叠的质谱图“分开”成为“清晰”的单个组分的谱图。图1 是这个过程的简单示意图。这里分别是总离子流色谱图(TIC)和质谱图。与常见的情况一样,这个色谱峰包含了多个重叠在一起的组分,而最高点质谱图实际上也是这些组分的组合图。质谱谱库检索只可能给出一个较差的匹配,而且不能识别所有构成这种组合谱图的单个化合物组分。

Amdis可以单独免费下载或NIST库光盘也包含此软件。


谢谢回复。

那么就说说Amdis是美国ANIS免费提供的软件?

它是可以自动兼容和识别各个仪器公司的GC-MSD软件和数据结果?


是的,免费的。可以选择各主要仪器公司的数据格式。
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原文由 继续前进(allenmeng) 发表:
非常强大的功能,不过还没摸透,到时还望不吝赐教。


如果有什么问题,欢迎一起探讨交流。
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问个小白问题,什么是Amdis? 是Agilent MSD Chem中自带的功能吗?


参考:http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20091226/2294579/
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原文由 花开见我(cai008) 发表:
原文由 fwonder(fwonder) 发表:

岛津的数据导不进去,心中有一万只草泥马在奔跑


岛津的数据,需要转换格式之后,可以导入。

没有其他的方便是真的


请问是要换换那种格式?是AIA格式吗?
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原文由 fwonder(fwonder) 发表:

岛津的数据导不进去,心中有一万只草泥马在奔跑


岛津的数据,需要转换格式之后,可以导入。

没有其他的方便是真的


请问是要换换那种格式?是AIA格式吗?


嗯。转换为AIA(.cdf)格式,就可以打开了。



是不是最新的仪器Ultra可以直接打开?
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岛津的数据导不进去,心中有一万只草泥马在奔跑


岛津的数据,需要转换格式之后,可以导入。

没有其他的方便是真的


QP2010 ultra能导出AIA格式吗?我找了好久没找到,问岛津工程师也说没有


File——Save Data File As,在弹出的对话框中,选择保存类型为“AIA(Adni)File(*.cdf),即可。



谢提供。岛津的新旧软件应该都会有的。
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