主题:【已应助】小分子与蛋白相互作用,小分子本身产生的光谱是否应该扣除?

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kite503
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最近在做双酚A (BPA)和一个蛋白的相互作用,用圆二色谱法。有几个问题想请教一下。

1、  看分子式,双酚A应该是没有手性的分子吧,可为什么我单扫双酚A溶液却能在200-220 nm扫出峰来?溶液是PBS+0.1%乙醇,双酚A浓度为1 mM。

2、  即然双酚A能扫出峰来,那么蛋白+双酚A扫出来的图是不是应该把双酚A的峰扣掉啊?如果需要扣的话,怎么扣,数值相减吗?

图中红线为纯双酚A的谱,黑线为蛋白+BPA的谱(均已扣除背景)。

谢谢各位了。


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kite503
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首先,我之前做CD的时候也遇到这种情况,本来小分子应该没有吸收,但是的确CD上面显示的是有光谱的,这个时候就必须把小分子的光谱从总的光谱中除去。第二,从你的蛋白质和小分子的图来看,你蛋白质的二级结构已经被破坏,在图中呈现的带有锯齿状的图形,理论上CD做出来的天然蛋白质图,是光滑的曲线。
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