主题:【已应助】计算信噪比时用TIC还是EIC

浏览0 回复15 电梯直达
sakuya
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请教各位老师,计算信噪比时,应该用TIC还是EIC?如果用EIC是否应该依据标准选择定量离子?如果采集时用全扫描方式,阈值是否要设置为0?
推荐答案:安平回复于2021/05/14
视定量方法而定。


如果定量方法是采用了tic图,那么就需要计算获得tic谱图的信噪比。


如果定量时才用了某个碎片的质量色谱图,那就应当使用mc图测定信噪比。

一般情况下,直接用tic图定量是不太推荐的,信号的信噪比一般比较差。
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wyu0
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如果选择了scan模式,计算信噪比应该选择EIC,否则各种离子都在里面算信噪比显然不合理。阈值要设置为0,否则测到的噪声不真实,阈值以下的强制抹平,那有可能计算不出信噪比,或者信噪比偏大很多倍。
深蓝
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xx_dxd_xx
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原文由 sakuya(sakuya) 发表:嗯,对,我也是觉得EIC比较合适。比如用气质进混标,有两个组分保留时间相同,如果用TIC算信噪比,可能有一个组分响应很灵敏,另一个组分响应很不灵敏,这样就无法证明单个组分的灵敏度。还有一个疑问是,如果用全扫描采集的数据计算信噪比,有没有必要把阈值改为0?我遇到一个情况,就是提取离子色谱图后,峰的前后没有噪声,或者噪声不连续,是不是因为小于阈值的信号被清除了,这样计算的信噪比会不会偏大?
我用默认阈值遇到过跟你说的一样的情况,所以后来只有定性的时候设阈值,定量都把阈值改成0,不然信噪比不正常。
xx_dxd_xx
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原文由 memory光阴(Ins_91d3b22d) 发表:采集时用全扫描方式,阈值是否要设置为0?阈值不需要更改,默认装机时初始参数即可。计算信噪比时,应该用TIC还是EIC?我用TIC比较多,用EIC也可以,EIC谱图更干净一点,不会受其它峰干扰
定性的时候要设阈值,定量的时候还是要改成零的,不然噪声被抹平了,形成信噪比很高的假象。比如阈值设150,但是噪声都不超过120,就都被抹掉了,看起来完全没有噪声,信噪比算出来不sim还高,这显然是不合理的。
cadicy
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我说一下我的理解,也可能不太对,抛砖引玉吧!
一般定量分析用的是SIM模式,你已经选择离子了,自然TIC图其实就是指定的几种离子,可直接做信噪比。这个时候TIC和EIC是一样的。
有的做定性分析用的是SCAN模式,指定范围内所有离子全扫描,这种TIC图就不适合了,应该挑选用特征离子组成的图做信噪比,可能就是EIC吧,不过我没这么弄过,一般提取离子流图谱出现的是分开的图(比如三种特征离子就会出来三种离子峰型图,从上到下列出来),没见过提取的还能汇集到一起的。
sakuya
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原文由 m3180044(m3180044) 发表:正确做法EIC。某些脑残国标TIC。想象一种情况,你的gc检测是一分三检测,fid,ecd,fpd,化合物只在ecd有响应,计算性噪比的时候会把三个信号加和后计算吗?你把每个离子想象成一种检测器类比一下是不是就想通了?
嗯,对,我也是觉得EIC比较合适。比如用气质进混标,有两个组分保留时间相同,如果用TIC算信噪比,可能有一个组分响应很灵敏,另一个组分响应很不灵敏,这样就无法证明单个组分的灵敏度。

还有一个疑问是,如果用全扫描采集的数据计算信噪比,有没有必要把阈值改为0?我遇到一个情况,就是提取离子色谱图后,峰的前后没有噪声,或者噪声不连续,是不是因为小于阈值的信号被清除了,这样计算的信噪比会不会偏大?
WUYUWUQIU
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m3180044
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正确做法EIC。某些脑残国标TIC。想象一种情况,你的gc检测是一分三检测,fid,ecd,fpd,化合物只在ecd有响应,计算性噪比的时候会把三个信号加和后计算吗?你把每个离子想象成一种检测器类比一下是不是就想通了?
sakuya
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原文由 安平(byron1111) 发表:视定量方法而定。如果定量方法是采用了tic图,那么就需要计算获得tic谱图的信噪比。如果定量时才用了某个碎片的质量色谱图,那就应当使用mc图测定信噪比。一般情况下,直接用tic图定量是不太推荐的,信号的信噪比一般比较差。
了解了,谢谢!
安平
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scan采集之前,如果怀疑目标组分浓度较低,建议使用阈值为0。

如果目标组分浓度均较大,那么就不太需要
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