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主题：【第十六届原创】OpenChrom软件使用介绍5_Amdis解卷积使用

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Chromcycle发表于：2023/09/25 08:58:00 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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OpenChrom软件使用介绍5_Amdis解卷积使用




前面说过OpenChrom是一款用于色谱，质谱，光谱等数据处理开源软件。可以处理不同仪器厂家的数据格式，支持通用格式。可以用于不同的电脑操作系统，例如Windows，macOS，Linux。前面介绍了初步使用的流程和方法，核对质谱结果，文件检索，保留指数计算及校对。本篇介绍Amdis解卷积使用。

1. Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出设置

要使用Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出功能，需要一些相应的设置。点击工具栏的Preference或Window菜单下面Preference，进入个性化设置。

路径：

Chromatography/Spectrometry----Peak Detector>Amdis(extern)。



图1 Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出设置




要使用Amdis解卷积，需要事先安装Amdis软件。在电脑上面找到Amdis32 Folder文件夹的位置放入。Select Folder，Apply and Close。另外对质谱离子m/z的范围，溶剂离子，柱流失离子，峰宽度，检出灵敏度，分辨率，峰锐度等按需要进行相应设置。可以参考Amdis的手册。

C:\tmp文件夹需要实现建立。在Folder Temp中输入C:\tmp（必须）。



图2 Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出设置



2. 解卷积检出及检索

流程如下：

调用GCMS数据文件，参见前面第一篇文章。

峰检出，在色谱上面右键点击，Peak Detector>Amdis(extern)。



图3 Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出


Edit Processor Options, use System Options, Finish:

图4 Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出





图5 Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出


软件会自动通过 AMDIS 系统运行，AMDIS 窗口会自动弹出（或者在Windows下方的显示栏看到Amdis的图标），在处理完数据后会自动关闭退出。经过Amdis解卷积后，在左上角的Peaks/Scan List就有Model Description列显示Amdis(extern)。同时也会在右下方的Feedback有Amdis检出的信息。





图6 Amdis色谱质谱数据解卷积峰检出结果



峰积分，在色谱图上面右键点击，选Peak integrator>Peak Integrator Trapezoid。参见前面第一篇文章。

峰鉴定，在色谱图上面右键点击，选Peak Identifier> NIST(extern)或Library File（MS）。

参见前面第一或第三篇文章。得到最终结果。



图6 检索结果



本文只是一个简单的例子，复杂的数据可以按照相同的方法来完成。

第五部分完。
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2023/9/25 9:43:32 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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