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主题：【已应助】蛋白组学数据分析

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p3311681
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发表于：2019/11/27 17:24:36 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊


1.蛋白组学下机数据，请问q.value有些是0，代表什么意思。

2.该组数据得出的是Abundance Ratio: (Medium, F2) / (Heavy, F2)这样的一个蛋白在中标和轻标样本里面表达丰度的比值，这种情况下还需要做P值校正吗？还是直接卡表达量的变化倍数就可以说明它是表达上升还是下降了
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hujiangtao
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2019/11/27 18:05:46 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
0应该是未检出吧
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2019/11/27 18:55:55 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由hujiangtao(hujiangtao)发表:0应该是未检出吧
但是它后面有对应的在三次重复里面的丰富比值啊
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welewolf
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2019/11/27 19:00:00 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
个人的理解是exp. q value代表经验Q值，其是对统计学P值的再统计。Q值越小越好。0的话应该是非常显著
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p3311681
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2019/11/27 19:00:35 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由p3311681(p3311681)发表:
原文由hujiangtao(hujiangtao)发表:0应该是未检出吧
但是它后面有对应的在三次重复里面的丰富比值啊
0的那些代表exp.q-value:combined,框出来的是蛋白丰度比值。软件用的proteome discover2.2
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歪果仁zZ
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2019/11/28 10:23:31 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
学习一下，请教
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