主题：【已应助】【求助】做MRM时出现杂峰...（附图）求解！3Q！

原文由 蓝精灵(xuxue_19861016) 发表:
1，不知道楼主样品基质是什么？是水解液直接进样吗？
2，楼主如果给出的图均为MRM，那么有理由推测楼主的蛋白质水解下的不仅仅是两种氨基酸，可能还有含该氨基酸的二肽或多肽，因此对该两种氨基酸的通道形成干扰
3，建议楼主可以做以下两个尝试：优化蛋白质水解条件；以该MRM液相洗脱条件为依据，调节梯度洗脱程序，使其他水解物的干扰峰与目标化合物的峰分离。

原文由 georgeding(georgeding) 发表:

原文由 lskane(lskane) 发表:
最近用LC-ESI-MS/MS测蛋白水解后的两种氨基酸，结果在保留时间外出现很多碎片峰 求解~~~ 上图片 干净的是标样 另一个是样品的 前一组分在1.8min出峰 后一个在3.8min出峰 其余都是杂峰

楼主，根据你的图谱，有这几点可能性：
1、样品前处理问题。样品处理不干净，本底很高，建议用一级质谱和相应的MRM方法来对空白生物样品进行扫描。可以窥见端倪。
2、基质干扰，建议改变色谱方法和质谱方法，如将等比例变为梯度，将质谱的定性和定量离子交换试一下，看本地是否降低。

原文由 georgeding(georgeding) 发表:

原文由 lskane(lskane) 发表:
最近用LC-ESI-MS/MS测蛋白水解后的两种氨基酸，结果在保留时间外出现很多碎片峰 求解~~~ 上图片 干净的是标样 另一个是样品的 前一组分在1.8min出峰 后一个在3.8min出峰 其余都是杂峰

楼主，根据你的图谱，有这几点可能性：
1、样品前处理问题。样品处理不干净，本底很高，建议用一级质谱和相应的MRM方法来对空白生物样品进行扫描。可以窥见端倪。
2、基质干扰，建议改变色谱方法和质谱方法，如将等比例变为梯度，将质谱的定性和定量离子交换试一下，看本地是否降低。

原文由 胜邪(nankingee) 发表:

原文由 lskane(lskane) 发表:

原文由 胜邪(nankingee) 发表:
一方面，可能和样品制备有关，即基质干扰。
另一方面，可以验证一下分析方法，即方法开发有没有问题。

头像很给力哈哈
如果是基质干扰是在质量分离器这个环节吗？不然不会被选作母离子并进一步打碎的吧
还有你说的第二点有点不明白哈 会影响吗？

换个采集的离子对试试。