主题:【求助】质谱库查询

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dxw09
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目前我使用的gc/MS型号是Finnigan Trace gc Ultra-Trace DSQⅡ(Thermo),DB-5柱,仪器配套的质谱库是NIST 05 MS Library (demo) & MS Search v2.0d。该质谱库数据太少了,演示版的,我的样品出峰达六七十个,很多重要物质没法定性,主要是肉制品挥发性香气成分,包括醛类、酮类、酯类、烃类等。
我用Xcalibur软件分析的数据文件格式是raw,还有sld格式的文件不知道是做什么用的。
特此咨询一下哪个单位能承接外单位质谱图解析的业务,解谱费用如何计算和收取?
或者是否有机会能允许本人到贵单位进行实验?需要什么样的条件?


或者有谁能提供比较全的NIST质谱库,请发我邮箱,dxw09@sina.com

小女子现在愁死了,实验时间紧张,拿着数据分析不了,头发都快掉光了!高人们请帮忙!
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yzulcl
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raw格式是采集的(保留时间-质荷比-强度)三维数据,是最重要的原始数据。
sld格式是样品表文件,是进样之前你自己写的,还有method文件是采集方法,也是进样之前你设置的。这些文件都只能用Xcalibur打开。从raw文件可以提取任意时间的质谱图并导出。
NIST质谱库是要花钱跟NIST买的,也可以买仪器的时候一起打包跟仪器商买。你们的仪器买的时候没有配?
或者你也可以上NIST网站看看,也许可以在线检索。
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vensterlz
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我们用的是DSQ,比你的型号老一些。有两张光盘,Xcalibur的那张光盘上只有一个演示版的NIST库,还有一张单独的NIST光盘,几百兆的样子,有两个库,一个main,一个replib。一般常见的都有。lz是不是少装了一张光盘?另外,可以去其他有NIST库的单位拷一个库来,直接覆盖就可以了。
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2012/7/9 9:56:23 Last edit by vensterlz
dxw09
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raw格式是采集的(保留时间-质荷比-强度)三维数据,是最重要的原始数据。
sld格式是样品表文件,是进样之前你自己写的,还有method文件是采集方法,也是进样之前你设置的。这些文件都只能用Xcalibur打开。从raw文件可以提取任意时间的质谱图并导出。
NIST质谱库是要花钱跟NIST买的,也可以买仪器的时候一起打包跟仪器商买。你们的仪器买的时候没有配?
或者你也可以上NIST网站看看,也许可以在线检索。


谢谢您的建议!

我后来找仪器工程师确认了,之前拷给我的是演示版,测试中心真正使用的是NIST 02,有147,194 个化合物的质谱图,但我的样品中仍然有很多物质没法定性。

NIST网我去看过,但用已有的未知物质MS数据在线检索匹配应该怎么操作?我只知道有输入某物质名称或CAS号可以查到对应的MS数据和MS图。

感谢赐教!
dxw09
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我们用的是DSQ,比你的型号老一些。有两张光盘,Xcalibur的那张光盘上只有一个演示版的NIST库,还有一张单独的NIST光盘,几百兆的样子,有两个库,一个main,一个replib。一般常见的都有。lz是不是少装了一张光盘?另外,可以去其他有NIST库的单位拷一个库来,直接覆盖就可以了。


嗯 ,是少拷了,已经拷回来全的了!

NIST 02
yzulcl
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raw格式是采集的(保留时间-质荷比-强度)三维数据,是最重要的原始数据。
sld格式是样品表文件,是进样之前你自己写的,还有method文件是采集方法,也是进样之前你设置的。这些文件都只能用Xcalibur打开。从raw文件可以提取任意时间的质谱图并导出。
NIST质谱库是要花钱跟NIST买的,也可以买仪器的时候一起打包跟仪器商买。你们的仪器买的时候没有配?
或者你也可以上NIST网站看看,也许可以在线检索。


谢谢您的建议!

我后来找仪器工程师确认了,之前拷给我的是演示版,测试中心真正使用的是NIST 02,有147,194 个化合物的质谱图,但我的样品中仍然有很多物质没法定性。

NIST网我去看过,但用已有的未知物质MS数据在线检索匹配应该怎么操作?我只知道有输入某物质名称或CAS号可以查到对应的MS数据和MS图。

感谢赐教!


赐教二字不敢当。
我所知也很有限,大家共同讨论,想办法解决问题。

确实,仅仅依靠EI质谱图的谱库检索匹配来对未知物定性,可靠性有限。即使谱库升级到最新的版本也仍然存在这个问题。
理想的办法是拿到标准品(对照品)在同样的仪器条件下上机走一下,比较保留时间和质谱图,可是实际操作起来很难做到。
另外的办法是:不完全依赖NIST谱库检索,改为人工解谱。可是对解谱的人的要求很高,而且也不能保证所有的质谱图都能解出来。
当然还有其他的办法:例如用更先进更智能的软件算法来匹配质谱图、采集高分辨质谱图、采集多级质谱图等等。
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symmacros
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Nist02的化合物确实有限,特别是肉类风味物质少的可怜。另外准确定性,还需要标样(保留时间)对比,或保留指数校正等方法来确认,单一的谱库检索结果不一定完全可靠。

用NIST网上的图谱和未知物质MS数据在线检索对比,但无法知道匹配度是多少。你只知道有输入某物质名称或CAS号可以查到对应的MS数据和MS图,但不一定每个化合物都有的。
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2012/7/15 16:42:38 Last edit by jimzhu
ctisteel
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sld格式是样品表文件,是进样之前你自己写的,还有method文件是采集方法,也是进样之前你设置的。这些文件都只能用Xcalibur打开。从raw文件可以提取任意时间的质谱图并导出。
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或者你也可以上NIST网站看看,也许可以在线检索。


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我后来找仪器工程师确认了,之前拷给我的是演示版,测试中心真正使用的是NIST 02,有147,194 个化合物的质谱图,但我的样品中仍然有很多物质没法定性。

NIST网我去看过,但用已有的未知物质MS数据在线检索匹配应该怎么操作?我只知道有输入某物质名称或CAS号可以查到对应的MS数据和MS图。

感谢赐教!


赐教二字不敢当。
我所知也很有限,大家共同讨论,想办法解决问题。

确实,仅仅依靠EI质谱图的谱库检索匹配来对未知物定性,可靠性有限。即使谱库升级到最新的版本也仍然存在这个问题。
理想的办法是拿到标准品(对照品)在同样的仪器条件下上机走一下,比较保留时间和质谱图,可是实际操作起来很难做到。
另外的办法是:不完全依赖NIST谱库检索,改为人工解谱。可是对解谱的人的要求很高,而且也不能保证所有的质谱图都能解出来。
当然还有其他的办法:例如用更先进更智能的软件算法来匹配质谱图、采集高分辨质谱图、采集多级质谱图等等。


我换了一台安捷伦的气质,数据报告有一个现象让我很困惑,在好几个不同的时间定性出同样一个物质,匹配度都还不低,有90以上。而且不只一个物质是这种情况,主要是一些长链碳烯烃和长链烷烃,重复地出现,按照最高匹配度来也可能有两三个位置都是最高的,都不知道哪个出峰时间才是真正对的,也不能确证这个是不是样品的风味物质,更无从定量。

请问前辈遇到这种情况是如何处理数据的?
symmacros
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一般讲一个化合物只能在一个地方出现,其它地方可能是异构体或相似的物质。这时候需要保留时间(保留指数)或出峰顺序来判断。
胜邪
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我这有NIST 05.我也不常用。
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2012/9/10 11:41:42 Last edit by nankingee
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