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主题：【讨论】多肽的y型离子相关

浏览0 回复7 电梯直达
lzh-zds
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发表于：2014/05/06 08:55:12 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
最近一直在纠结一个问题，以肽段序列FDAASPKTYR为例，为什么用PeakView软件计算这个肽段的y10离子与肽段DAASPKTYR的分子量一样呢？
该帖子作者被版主 八杯水加 2积分， 2经验，加分理由：鼓励发帖
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八杯水
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2014/5/6 9:04:59 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
不明觉厉。楼主做的工作好高级呀，跟LCMS相关吗？
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lzh-zds
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2014/5/8 17:16:26 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 八杯水(djj85411) 发表:
不明觉厉。楼主做的工作好高级呀，跟LCMS相关吗？
是啊 是用LCMS的 你知道为什么吗
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八杯水
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2014/5/9 8:35:56 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 lzh-zds(lzh-zds) 发表:
原文由 八杯水(djj85411) 发表:

不明觉厉。楼主做的工作好高级呀，跟LCMS相关吗？
是啊 是用LCMS的 你知道为什么吗


不知道，没接触过哦。peakview计算出来的是分子离子峰还是准分子离子峰呢？
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chenrain
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2014/5/9 9:31:20 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
lz,是y9一样，你这序列，C端数过去是一样的，Y离子是电荷在C端的，所以一样才正常。
Fragments will only be detected if they carry at least one charge. If this charge is retained on the N terminal fragment, the ion is classed as either a, b or c. If the charge is retained on the C terminal, the ion type is either x, y or z.
该帖子作者被版主 djj85411加 3积分， 2经验，加分理由：讨论
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yzulcl
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2014/5/10 9:18:13 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
肽段的abc和xyz离子是分子离子的肽键断裂生成的子离子，你这个肽段总共10个氨基酸单元，只有9个肽键，哪里来的y10？

根本就不存在a10，b10，c10，x10，y10。根本不存在的东西就别纠结了。

唯一可以算的是 z10，因为它其实就是 [M+H-NH3]+，而且这个中性丢失的氨还必须是来自最左端的1号氨基酸的(alpha)氨基，否则就算m/z能对上（比如丢失的氨来自侧链氨基），也不是z10
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2014/5/10 9:54:34 Last edit by yzulcl
chenrain
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2014/5/12 13:36:11 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 yzulcl(yzulcl) 发表:
肽段的abc和xyz离子是分子离子的肽键断裂生成的子离子，你这个肽段总共10个氨基酸单元，只有9个肽键，哪里来的y10？

根本就不存在a10，b10，c10，x10，y10。根本不存在的东西就别纠结了。

唯一可以算的是 z10，因为它其实就是 [M+H-NH3]+，而且这个中性丢失的氨还必须是来自最左端的1号氨基酸的(alpha)氨基，否则就算m/z能对上（比如丢失的氨来自侧链氨基），也不是z10


ls的，对于10个氨基酸的肽段，确实有y10，y10就是它的（M+H）+。

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纯粹
v2800082
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2014/5/12 21:50:05 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
PeakView软件好像有点问题。我是用另外软件的，其实你用这些的目的就是想确定多肽的子离子是吧？
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手机版： 多肽的y型离子相关
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