主题:【已应助】Thermo LCMS TSQ Instrument Method里面参数的意思

浏览0 回复7 电梯直达
zhongyao0601
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对Thermo的仪器参数一直有几个搞不懂的地方,望大神能够解答:
1.TSQ的分辨率怎么算的?到底是啥意思呀?
2.如图所示,其中的Scan Width是什么意思呢?

3.图中的Chrome Filter Peak Width又是啥意思呢?
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huomiao
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分辨率大家的机子都差不多是以分子量相差多少能分辨为计算的

它的Scan Width好像是和它扫描计数有关,这个工程师来装机的时候讲过一下,忘了。
hujunjie
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zhongyao0601
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原文由 hujunjie(hujunjie) 发表:
棱镜的一个参数  需要优化
能讲清楚一点点吗?谢谢!
yellow47
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1.分辨率按半峰宽算,也就是你图中的peak width,一般三杆都用0.7,即峰高一半处的峰宽是0.7 Da,换算一下,在基线上就基本是1 Da,单位质量分辨。
2.Scan width是针对质谱图来说的,指数据采集时候的宽度,比如你扫m/z=100,scan width=0.002,那么你采集到的数据就是99.999到100.001这个范围。
3.chrome filter是针对色谱图来说的,简单来说就是你设定一个值,比如10s,在色谱图上峰宽小于10s的色谱峰,软件就认为它是噪音而不是信号。后续数据处理时自动积分不会积这个峰。
zhongyao0601
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原文由 yellow47(yellow47) 发表:
1.分辨率按半峰宽算,也就是你图中的peak width,一般三杆都用0.7,即峰高一半处的峰宽是0.7 Da,换算一下,在基线上就基本是1 Da,单位质量分辨。
2.Scan width是针对质谱图来说的,指数据采集时候的宽度,比如你扫m/z=100,scan width=0.002,那么你采集到的数据就是99.999到100.001这个范围。
3.chrome filter是针对色谱图来说的,简单来说就是你设定一个值,比如10s,在色谱图上峰宽小于10s的色谱峰,软件就认为它是噪音而不是信号。后续数据处理时自动积分不会积这个峰。


1.如果Peak Width为0.7,那么用508来计,那么分辨率是不是就是508/0.7=725,这个分辨率与指标的差远了呢!?
2.还是不太懂,由于三杆本身的分辨率低,Scan Width设置成0.002和0.2又有多大区别呢?我怎么感觉跟没区别似的?!
3.这个明白了,谢谢!
yellow47
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指标都是写着玩的,要较真的话,谁说是用508来算分辨率呢?再说了0.7只是最常用的半峰宽,你看你在软件里还可以设的更小,没必要去纠结低分辨质谱的分辨率。
一个标准的质谱峰,用轮廓图来看,最中心的0.002和0.2,采集到的强度都不一样了。
elevern
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这是Vantage的机器,最低可以放到0.1的 Q1 window。对于低分辨,都是用半峰宽来算分辨率的,拿三杆模拟HR-MS是没有意义的;
在Q1 window固定的情况下,scan width的设定没有什么意义的,窗口已经固定了。更何况SRM模式一般不会用profile来采集的,vantage倒是会高一点,这是最后数据处理的问题。
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