collin2429回复于2006/11/06
自己下载看了!!
不过这里有一点介绍!
一、 什么叫生物芯片
简单地说,生物芯片是指能对生物分子进行快速,并处理和分析的邮票大小的固体器件。具体地说,生物芯片是指在一块大小不等(一般约1~2㎝)的玻璃片、硅片、尼龙膜、凝胶或金属等载体材料上,以大规模阵列的形式排布了不同的生物分子探针(蛋白质、核酸等),形成可与靶分子相互作用,并行反应的固相表面。将芯片与荧光标记的靶分子进行化学反应(如杂交、免疫反应等),经过激光扫描后,不同反应强度的标记荧光将呈现不同的荧光发射谱征,用激光共聚焦显微扫描仪或CCD相机收集信号后,经计算机分析数据结果,从而获得相关的生物信息。
二、 生物芯片的特征
主要特征:高通量,集成化,自动化,并行化(举例)
生物芯片的概念来自计算机芯片,因为其制作过程中采用了类似集成电路制作中的微加工技术,使得生物学实验中一系列不连续的过程如样品准备、生化反应及检测等步骤连续化和微型化,在一个芯片上集成大量的生命信息。
三、 科技背景
1、 生物芯片技术的诞生是人类基因组计划启动、执行和完成的必然产物,也是生命科学进入后基因组时代的发展需要。
2、
3、 传统的建立在电泳基础上的基因表达、测序、突变、和多肽性检测以及Northern-blot、Southern-blot等研究方法只能对有限的基因进行研究且费时费力,很难在全基因水平进行系统、宏观的研究。
四、 生物芯片的分类
根据不同的标准可分为不同的种类,目前生物芯片的分类基本如下:
生物芯片 = 信息生物芯片 + 功能生物芯片
信息生物芯片 = 基因芯片 + 组织芯片 + 蛋白芯片
组织芯片 = DNA芯片 + 寡核苷酸芯片
功能生物芯片 =微缩芯片实验室+ 微流体生物芯片
常用的生物芯片主要是这三类,即:基因芯片、蛋白芯片、芯片实验室
五、生物芯片的制备和检测
由于时间有限,在这里我只给大家介绍基因芯片的制备和检测。
基因芯片技术是众多学科和技术相互渗透融合的产物,其产生背景是人类基因组计划的实施和发展。将成千上万种核酸探针分子有序的排列在面积不大的载体材料上并与标记的样品核酸杂交,通过放射自显形或荧光扫描显示,可一次获得大量有用的生物信息。基因芯片的相关操作包括:基因芯片的制备、靶基因的制备、杂交和检测。
一般的来说基因芯片的制备和靶基因的制备都有生产厂家来完成。我给大家介绍的是有关杂交和检测方面的知识。
在介绍芯片杂交之前我先给大家介绍一下芯片杂交中要用到的探针标记。(以基因芯片为例进行说明)
DNA芯片检测的技术实际上就是核酸杂交技术,是由靶分子和探针组成的基本杂交体系。因而在探针标记时,还需要体外扩增并加以标记才能在与芯片上的靶分子杂交后有足够的信号强度供检测用,特别是采用诊断芯片检测血液中微量病源微生物的基因核酸时,杂交前一定要对样品进行扩增,并在扩增过程中进行探针标记。探针的标记主要包括:(标记分子以RNA为例)
○1样品总RNA的提取,○2mRNA的分离和纯化,○3逆转录生成cDNA,在此过程中用Cy3-dUTP标记对照细胞的mRNA(正常的),用Cy5-dUTP标记实验细胞的mRNA(一般是指有病的)。
1、cDNA芯片杂交一般流程图
总RNA样品的制备
反转录成为cDNA并掺入Cy3(Cy5)-dUTP
通过加RNase 清除探针中的RNA
用MicronM50柱浓缩探针溶液
混合两种探针并将体积用水调至19.5微升
将探针与杂交溶液及非特异性阻断剂混合并预热1h
在42度水浴锅中杂交芯片24~28h
冼片,2XSSC/0.1%SDS轻摇,室温下15min
冼片,2XSSC/0.1%SDS轻摇,室温下15min
冼片, 2 X SSC,,轻摇,室温下15min
干片,于50mL试管中离心,1000r/min
扫描芯片和数据分析
影响杂交的因素包括:
○1固定在芯片上的靶分子数,
○2探针浓度,
○3杂交双方的序列特异性,
○4杂交体系中的盐浓度,
○5杂交时的温度,
○6杂交溶液的PH值
一般来说,选择的条件要使这个反应体系中的绝大多数杂交反应处于最佳条件下,从而使所有的真阳性反应尽可能的体现而假阳性尽可能的减少。
li5678回复于2006/11/10
因为不太懂哦
谢谢三楼,
真的是要先普及基础知识啊
jackydai110回复于2006/11/18
谢谢了哦