色谱数据处理工作站的工作过程主要包括3个步骤:
(1)在首次进样条件下,选用设置一套参数在保证原始谱图数据不失真的情况下,采集原始谱图数据,以备下一步的调用再处理。
(2)对进一步采集的原始谱图数据进行再处理。第一步采集的谱图信号数据包括色谱峰和基线(漂移、噪声)两大部分,这一步的目的就是设法将样品峰(无论大小)首先识别出来,并根据基线的漂移情况,对不能很好地分离的组分,确定基线位置,统称基线校正或称为峰的自动基线补偿处理,然后把色谱峰面积以及其他有关参数,如峰高、保留时间、半峰宽等储存起来,若发现有漏判峰或者分离不好的峰处理补偿方法欠佳,可调节必要的参数或功能,调出原始谱图数据再一次进行处理直至满意为止。
(3)第3步是采用第2步存储的峰数据,根据选择的分析方法进行定量计算,获得分析样品的定量结果,报告通常以表格的形式打印出来,如发现结果有问题,可回到第2步重新对原始谱图数据处理后再计算。最坏的情况下要求重新进样,再进行数据处理。