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主题：【已应助】是不是应该用乳酸菌的通用引物呢？

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konika
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发表于：2020/04/08 11:07:46 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我做的是奶酪中筛非发酵剂乳酸菌。但是现在筛出来的菌测序之后用blast比对出来后几乎全是表皮葡萄球菌，要不就是不可培养细菌。然后我的引物是v3-v4区，
Nobar-341F（CCTACGGGNGGCWGCAG）。 Nobar-805R（GACTACHVGGGTATCTAATCC）。大家觉得我的引物有问题嘛？是不是应该用乳酸菌的通用引物呢？
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2020/4/8 11:29:42 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
个人感觉引物问题不大，乳酸菌用常见的通用引物就可以鉴定。极可能是筛选条件有问题，不利于乳酸菌生长。nslab一般是lactococcus属和lactobacillus属的，lactococcus属的菌株25℃培养，lactobacillus可以用专门的筛选培养基试试，例如sl或酸化mrs。最好厌氧。
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