主题：【第十六届原创】GCMSsolution 色谱峰定性操作步骤

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红小豆发表于：2023/08/01 19:26:54 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

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GCMSsolution 色谱峰定性操作步骤

概述

Shimadzu GCMS使用GCMSsolution工作站进行数据采集和处理，全中文界面，操作较为简易。色谱工作者在获得数据文件之后，如果需要进行色谱峰定性操作，可以参照此文件执行。

简介

当以scan方式采集的质谱数据文件已经保存，此时运行GCMSsolution的“GCMS再解析”模块，按照下文步骤执行操作。

1 打开数据文件

点击GCMSsolution再解析模块之“助手栏”的“定性”图标，并点击菜单栏中的“文件”-“打开数据文件”，将需要处理的（必须为scan方式采集的）数据文件（后缀为.qgd）打开，如图1所示。

图1 打开数据文件

此时需要首先设置候选质谱库，点击菜单栏的“定性”项目，选择“定性参数”，如图2所示。

图2 定性参数

在系统弹出的“定性参数”-“相似度检索”项目中，指定候选质谱库文件，如图3所示。

参数表列

最小SI：系统检索结果中相似度指数（SI）低于此值的结果将不予显示。

最大命中数：系统检索结果中给出的候选组分个数。

检索深度：可以指定重要碎片个数，以提高检索速度。

反检索：以质谱图中的质谱图为基准极性质谱检索。可以消除质谱图中噪声和背景干扰影响。

保留指数允许误差：

根据数据文件中组分的保留指数与谱库中保留指数偏差，滤除检索结果。

后检索：再初步的检索结果中，可以限定索引，缩小命中化合物范围。

图3 相似度检索

2 获得色谱峰顶质谱图

以保留时间11.5min的色谱峰为例，在目标色谱峰顶点或者顶点附近双击，获得此时间点的质谱图，如图4所示。

图4 获得色谱峰顶点附近质谱图

3 执行背景扣除

点击GCMSsolution再解析图标中的“扣减质谱”图标，如图5所示，在目标色谱峰附近的基线部位双击，系统自动扣除背景获得新质谱图，如图6所示。

图5 扣减质谱

图6 扣减之后的质谱图

4 检索质谱库

在质谱图中点击鼠标右键，再弹出菜单中选择“相似度检索”，如图7所示。

图7 相似度检索

GCMSsolution系统自动返回检索结果，如图8所示。

图8 质谱检索结果

至此可以获得定性结果。

背景扣除的方式

GCMSSolution支持四种背景扣除的方式。

A点-B点：上文中操作方式。

A区间-B点：首先点击“平均质谱”图标，然后拖动鼠标左键，选中色谱峰内区间，然后点击“扣减质谱”，双击基线某数据点。

A点-B区间：首先色谱峰内双击，然后点击“平均和扣减质谱”，选中基线中的某个区间。

A区间-B区间：首先点击“平均质谱”图标，然后拖动鼠标左键，选中色谱峰内区间，然后点击“平均和扣减质谱”，选中基线中的某个区间。

小结

简述GCMSSolution工作站质谱检索的基本步骤。

附件：

GCMS 定性操作步骤.docx

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