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主题：【谱图】使用红外光谱分析蛋白质二级结构

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superchx
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2014/4/11 20:35:19 12楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 sunweizheng(sunweizheng) 发表:

我也想知道 我现在用的是peakfit软件 但不知道怎么设置参数


您好，最近我也开始使用peakfit做红外谱图的分析，主要是解析Amide I 的二级结构，针对相关参数的设置方面我不是很明白，像baseline的选择，smoothing，filter，Amplitude依据什么设置?好像影响挺大的，设置不同，包括峰位峰个数都不同，很是困惑，您能不能给予一点指导呢？非常感谢您！
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superchx
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2014/4/11 20:44:56 14楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
最近我也开始使用peakfit做红外谱图的分析，主要是解析Amide I 的二级结构，针对相关参数的设置方面我不是很明白，像baseline的选择，smoothing，filter，Amplitude依据什么设置?好像影响挺大的，设置不同，包括峰位峰个数都不同，很是困惑。楼主这个问题解决了吗？能给予一些指导吗？
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zwyu
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2014/4/12 23:13:09 15楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
帮着转给dongshuting版友吧，有提类似的问题。

原文由 lh2000d(lh2000d) 发表:
其实就是将酰胺I谱带中包含的二级结构单元信息用曲线拟合的方法计算出来。
酰胺I谱带是一个很宽的吸收峰，覆盖1700-1600cm-1，其实是由几个子峰叠加在一起的，有α螺旋的，β折叠的，β转角的无规卷曲的，用曲线拟合的方法算出来每一结构单元的峰面积，峰高等，看每一结构单元在这个大的吸收峰中所占的面积百分比，即可得到每一二级结构单元的相对含量。当然你首先要知道到底有几个子峰，每一个峰的中心位置，拟合时要设定每一峰的半高宽以及峰型。

这种方法跟晶体衍射测出来的结构符合的还是相当好的。
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