主题:【第二届网络原创大赛作品】生命之贵在于勤学-记录NIR建模工作

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睦惜
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各位,由于之前的参赛帖子发早了不算数了。我又整理后重新发上来了。希望朋友们能够继续给予我支持。谢谢!~~

生命之贵在于勤学——记录NIR建模工作

我这个人开始正题之前总是爱说些废话。

这个生命之贵,在于勤学的题目既是对自己的勉励又是本文的引子。实际要讲给大家听的是我在中国农业科学院作物科学研究所重大工程楼开放实验室实习的全过程,实习和之后正式工作的内容都是NIR的数学建模和应用的研究。

我实习是从08年10月15号开始的,一直到今天。我原本是学习制药工程专业的,北京化工大学工学学士学位,实习时刚上大四。学业内专业实验不多,除去分光光度计我从来没有接触过其它光谱分析仪器和技术。对于近红外我算是纯纯的初来乍到。真正的建模工作是从我拜读完严衍录教授的《近红外光谱分析基础与应用》一书后开始的,还专门在领导和众多师姐面前以PPT的形式“汇报”了学习成果。96页的演示文稿,回想当时真是太傻太可笑了,一本书刚刚读完就敢给众多的硕士和博士上课,简直是有些自不量力,知道不知道的都敢说,连“LED光源是不好的旧技术”都出来了。最后领导的评价是肯定的“你口才好,什么都敢说”。

现在才知道读大书的精辟是要读出来而不是读进去,600页要先看成6000页再看成60页最后看成6页。动不动就粘贴90几页的PPT跑去汇报是有些“愣头青”,到时候领导一问问题就只能照着屏幕读上面的内容,一点真东西都没有。嘻嘻,不说以前的自己了!

09年的6月底终于拿到两证,这回可是个纯纯的社会人了(有点后悔没去考研)。到今天再去回忆一下实习的全过程有一点困难,不过为了应上题目只能在电脑前绞尽脑汁了。我这个人用导员的话说就是“拥有充沛的感情”。所以现在最怕的就是回忆,目前为止我还不敢去回忆毕业的那一幕幕,7月1回来再上班的时候都是心虑憔悴,回校一周几乎每天都是大口的喝酒大声的痛哭然后就找厕所去吐。我绝无法找到别的方式来祭奠我即将逝去的大学生活了。跟朋友拥抱都是紧紧的生怕这么一毕业就再也见不着了。我记得回来后改QQ的个性签名“很多事情已经没有勇气再去回忆,泪水依旧难以冲洗掉心头的忧伤。对于一些朋友,从此人海世事两茫茫”。遇见QQ上的学妹聊了一些关于珍惜大学时光和毕业离校的话,当时就再也忍不住伤感躲到档案室的角落里独自掉泪去了。“请你珍惜大学这个美丽而又短暂的时光。等你毕业你就会发现,23岁以后的青春是光速的,生活和社会的压力会使你每天以惊人的速度变老。再没有纯纯的友情、再没有纯纯的青春、再也没有你可以肆无忌惮生活和学习的地方让你如此留恋”。谈到感情我告诉她大学期间一定要去恋爱,并给她讲了个酸楚的故事“我有个同年级不同专业的女性朋友,她爱玩学习也好每天都活得快快乐乐。毕业之际我们聚了一次,5男2女。酒醉之时彼此相视而泣,泪水就像决堤的堰塞湖一涌而出。她更是哭的泪人一般,之后她紧紧的拥抱我们每一个人告诉大家青春已逝梦已不再,最最后悔的是大学里没有谈一场真真正正的恋爱,青春之际彼此之间最真挚的时间里感情却是个空白。酒罢回校的路上她把满脸的热泪灌进了我的衣领”。哎!~~闲话太多了,还是书规正撰、言续正说吧。(*^__^*) 嘻嘻……先去抹泪。
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睦惜
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2008年10月5号左右在校准备论文的时候就听说会有6个名额到农科院去实习,内容为核酸测序等,捎带手解决掉毕业论文实验拥堵的问题。我当时基本就已经打定主意到院长那里去请缨了。10月10号正式开始推荐的时候仗义的院长竟然在我没有积极报名的情况下推荐了我,这使我大感意外。最后书记主动打电话到我手机上询问我的意向和告知农科院方面对实习的待遇及学校对到农科院实习学生的论文安排等事宜,业已确定名额。连我5个人,农科院因为宿舍床位不够砍掉了一名。5人当中连我有3位校学生干部、1位干部“家属”、一位专业总成绩探花。时间无多则即刻打点行装准备上路。

10月15号当天中午,校车早早的就发动了等着我们上路。我几乎把宿舍里属于我的可以移动的所有东西搬上了开往化大本部的班车。一路上班车狂奔不止除了运煤的“大十轮儿”没有它不敢超的。到化大的时候将近下午1点。指导老师简短节说后独自扬长而去。

我们打车自农科院东门而入止于重大楼门口的大树旁。安排宿舍、见领导、分岗位、参观重大楼实习第一天就这样在下午3点前结束了。各人即成鸟兽状散去。

实习刚开始的时候我分配的工作就是NIR(还有探花也是),开放实验室有一台比较久远的近红外仪器,是德国的布鲁克道尔顿公司出产的MPA型傅立叶近红外光谱分析仪。农科院的对应专业是分子生物学、生物学及生物化学。我是学习制药工程的课业内所学习的内容几乎没有与其相关的。近红外又隶属于光谱分析化学一类,我实在显得太像个门外汉了。10月份剩下的时间里我就是每天面对着这个机器度日的,没有相关资料,说明书和OPUS软件版本都是英文的,看到那些英文字母在我的眼皮底下排排站的时候我头脑里就只有一个字,那就是“吐”。先开始的前5天里就是闲着,领导(味精)从窗外经过的时候还会来鼓励一下。作物种子的近红外模型建立是味精的一个小愿望,“这个工作如果成功不会给实验室带来任何的盈利,相反实验室还会为此搭进去很多的时间和金钱。但是如果我们具备了成功的经验再把它编辑成文章推广到整个农口系统那将是一件非常有意义的事情”。显然最开始的认识还是很肤浅的,我们不了解NIR的真正意义,也不知道它的发展远比我们想象的要迅速和完善。

以后的数天中一种莫名的精神上的强大动力驱使着我开始给OPUS软件系统编写翻译手册,只要是目之所见能力所及的地方我都付出了相应的努力。无奈对NIR的了解少之又少,编写翻译手册的工作遇到了很大的阻力,那时就发现牛津字典和百度谷歌的确不是万能的。面对众多的英文缩写我只能表现的束手无策。开放实验室的工作是很繁复很忙碌的味精根本无暇顾及我们在NIR上是不是有前进,也许任何事情都是需要时间慢慢安排的吧。在08年的10月底我们终于迎来了一个工作的高峰期。味精为我们联系了国家种质库的当年玉米种子。2183份不同的玉米种子足够我们忙上3个月甚至更久的。于是实习的每一天都开始充实起来了。
睦惜
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11月的一天NIR的服务站挂掉了,非常彻底,就连电脑开机都实现不了了。于是师姐只好给这台年久失修的服务站刷了系统。当然OPUS软件也请布鲁克的工程师重新安装了。这位来提供指导的工程师正是在严衍录教授书中提到的赵丽丽女士。渊博并且为人和善的她不但给服务站安装了崭新的OPUS 5.0中文操作系统还当场排解了我们在建模方面的一些困惑并给予了非常细致的软件运用指导。仅隔2天又给我们拷贝了一些NIR方面的资料,严衍录教授所著的《近红外光谱分析基础与应用》一书即是其中一册。得到资料如获至宝,但简单而又繁重的玉米种子光谱采集工作终究还是让我放弃了对这些资料的深入研究。以后的好长一阵时间里我都是伴随着这些玉米种子度过的。

北京的冬天是一个很奇特的季节,干燥、阴冷、降水少的可怜。虽然实验室是通暖气的也可以开放空调但是屋内的气温仍然低的要命。100多平米的实验室常驻人口只有3位,每天开机的设备不超过4台。紧邻MPA的设备是一台放在通风橱里的“高龄”蛋白质测序仪,岛津品牌。除了往排气道里鼓风另外还得打开3面窗子,不然会死人的。并且倒霉就倒霉在光谱采集工作它太过简单了总是重复那些简单的操作就连暖身子的机会都没有,手指会冻得僵直,脚会冻麻,长时间在这样的环境里还会打哆嗦。一般的情况下我们都是把白大褂套在羽绒服的外面,空闲或者休息的时间就去人多的实验室串串门子。刮风的几天最痛苦。国家种质中心比较靠近农科院的西门,也就是面对理工大学的正门一侧。而作物所的重大工程楼比较靠近农科院的东门。我们每天早上8点半会拉着小车去种质中心提样本玉米,拉回重大楼进行光谱采集。下午5点半之前再拉回去点清数目入库,这些玉米在我们工作完成后将进行选拔,优质的会被送抵世界各地进行国家之间的农业技术交流,所以是不能留在中心之外保存的。刮风的天气里,前进的每一步都是艰辛的,每天200多份的玉米放在车上对一个一般的青壮年男人已经足以构成拖累了。可想而知一个冬天的傍晚当我面对一车的玉米时心中难免会升起一种懒惰或者抵触的情绪,但是工作就是工作,不能有任何的挑剔。完成它才是这一天结束的唯一标志。于是就这样的日日重复着。
睦惜
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对待工作,你说你干一行爱一行得说的出你的爱在哪,不能不明不白。实话说到现在了我才刚刚爱上近红外这一行,明知道在农科院干不长久也明知道靠NIR很难找到新的工作,可还是不能控制的一头扎进去了。现在我就是希望模型能建成功,工作能取得味精的肯定,论文能顺利发表。我没有更多的名利上的要求,不然我不会扎在近红外的工作岗位上,我只是希望一年来甚至会更久时间的工作能阶段性的画个句号;能有让人满意的成果摆出来;能给自己的辛勤一个交代。

生活和工作中我会很容易对某些东西或人产生感情,对NIR从懵懂的开始到清晰地认识消耗了我近12个月的青春,我把我认为是宝贵的年华献给了最基础的工作而且以后的很长时间里还是会这样继续下去。与MPA初次相见的时候我感觉到它是那么的冷漠和呆板,它不像别的仪器那样每天都有人维护它、使用它、为它“暖身子”。只有每年的3到5月和8到11月才会有很少的人光顾它,其它的时间里它就像鸭子群里的小鸡一样无人问津、不加理睬,就连工作站也会经常“欺负”它。而我开始了解它、拌陪它、给它爱与呵护,在相处的过程中它教会了我知识、培养了我的技术能力,而对MPA不断加深的了解也使我与它建立了深厚的感情。我不在实验室的时候会总想起它;天气湿度大、雨水勤的时候我就会去检查它的湿度计及时的为它干燥;长久无人问津的时候我会去叫醒它与它交流。现在再去碰触MPA的时候我能很明显的感觉到它已不再是冰冷呆板的了,仿佛沾染上了人的气息,我也相信它会在适当的时候在工作上给予我丰厚的回报。

玉米种子光谱采集工作开始以来我终于在一个明媚的下午找到了这个无聊工作的乐趣。我发现了花玉米,紧跟着几乎一个兴奋接着一个兴奋,白马牙、花糯、红玉米等等等等长相特殊的玉米种子相续展现出来自身的魅力。从小生活在皇城的我都不曾知道玉米的颜色和形状如此变化多端,大如马牙、小如稻米、五彩斑斓。原本面对工作的消极态度在那个下午一扫而空。我现在觉得那是我的成熟战胜了我的幼稚,对于NIR工作我才刚刚上路而已。

记得很小的时候爸爸就常说一句话“追求给你方法;奋斗给你途径”。现在我还是把这句话当作是我的座右铭。在生活中和工作上它总能给与我启示和帮助。2008年11月的那个明媚的下午,我似乎一下子就成长起来了。懂得离开“象牙塔”后要如何面对全新的生活和工作;要如何去实现从前口头上的自我价值。我热爱上近红外工作的原因就在这里,从懵懂到成熟,是它给予我最重要的启示。我想无论以后我从事何种职业和经历何种生活,我都永远不会忘记在我青春最宝贵的年华里从事近红外基础工作的这段时间和岁月。



(持续未完)
chemistryren
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看了斑竹的帖子,虽然我不懂NIR这块,但斑竹把一些经历和感受写出来让大家分享,很好.
睦惜
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原文由 chemistryren 发表:
看了斑竹的帖子,虽然我不懂NIR这块,但斑竹把一些经历和感受写出来让大家分享,很好.


谢谢谢谢,其实我的本意就是想写写这段经历,希望初涉NIR的朋友能少走弯路。(*^__^*) 嘻嘻……
闲鹤野云
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原文由 capezx 发表:
原文由 chemistryren 发表:
看了斑竹的帖子,虽然我不懂NIR这块,但斑竹把一些经历和感受写出来让大家分享,很好.


谢谢谢谢,其实我的本意就是想写写这段经历,希望初涉NIR的朋友能少走弯路。(*^__^*) 嘻嘻……

继续呀,搞点不同玉米的光谱上来看看
睦惜
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玉米光谱的采集工作接近尾声的时候,有一天味精突然问我种子的光谱重复性好不好。我哑然!因为扫描的东西太多了,虽然进行了分类而且很细化但还是没有什么记忆。于是就把以前的光谱图翻了一遍。结论是:每份种子测3到9遍不等,谱图重复性好的占大多数(这是源于仪器比较稳定)。于是味精指示:光谱都采集完后要返工,把谱图重复性不好的重新做。本来光谱采集完后还担心没事干,现在就有活忙喽。后来证明返工是个最大的错误, 做了很多的无用功。当时由于没有事先学习相关资料又急于上手,味精也不是真懂近红外建模,造成了工作上的指导失误,岂知近红外的建模时要遵从随机的原则,不能给它施加人为的影响。时间就是这样被浪费掉了。

11月26号上午2183份玉米的光谱总算采集完了。整理了一个下午的谱图资料,需要重新测图的有223份,于是只好每天继续跑种质库拉玉米测。所有的重测玉米的编号都是蹦着的,可我们取种子不能蹦着拿。所以一天要跑很多趟种质库。在种质库工作的是退休返聘的两位女老师。王老师是个打扮比较时尚的北京老太太,一家人都在农科院给国家卖命。她为人和蔼,会主动跟我们聊天,不过话题多集中在家长里短上面。张老师是个比较沉默的人,她在办公室的封口机旁用玻璃瓶子养了两只小乌龟,每天早上我们去的时候都能看到她给乌龟喂食换水。由于我们到种质库的次数太多了,跟俩老太太混得烂熟,到后来我们重测玉米的时候库门的钥匙就放桌上我们去了直接拿就好了。库里除了各种作物的种子还会存放杂七马八很多东西,比如自行车、食用油、大米、水果等等。都是农科院发给职工的东西。后来我跟同学聊农科院的事情还总是会说“农科院就是比较有特色,你别看不怎么发奖金,但农副食品比哪发的都多”。而且我还经常会说“别看农科院不如中科院财大气粗,可农科院有的是地头,三环里边拿价值20亿的地种萝卜,郊区的地头更是数不胜数”。

我工作的地方是开放实验室,这里面除了3位领导1个兵就再也没有正式员工了。人员按照工作内容分成4部分:领导(兵也算在领导里,因为他们都是正式员工);办公室;研发部;测序部。办公室的人员没有什么文凭,平日里跟兵一样为领导工作,协助管理大家。研发部都是一水的生物学硕士,我来了就多了个制药学学士。工作内容是掌握所有高精端仪器的日常使用和维护,为自己人和外单位的提供技术支持。当然有时候自己也可以搞点小项目,在这点上味精是个极其开明的领导,她绝不会扼杀任何人的求知欲。测序部有3个本科生20多个大专生,他们的任务就是拉到核酸测序的业务并为客户提供可靠的结果报告。这是个为实验室创收的部门,也正因为如此领导们的“统治”主要针对他们,于是他们就成了“弱势群体”,从我到这里的第一天就知道领导和测序部的孩子们一直以来都进行着相当严酷的斗争,他们的生存环境是恶劣的。可话说回来,正是因为在这样的生存环境中斗争他们才无暇顾及自身的发展。很多时候我都会为他们担心,离开这里的话他们还能干什么,一点一点丧失的素质还怎么培养回来。希望我所有的担心都是杞人忧天吧。



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睦惜
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熊猫宝宝
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〓疯子哥〓
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原文由 capezx 发表:
应R斑竹要求,给大家传一些玉米的光谱吧。

美国玉米

墨西哥玉米

南斯拉夫玉米

匈牙利玉米

意大利玉米


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