2.DNA分析
DNAClub:DNA处理软件
JaMBW:分子生物学软件包
DNATool:功能很全面的DNA序列分析工具包
pDRAW:DNA分析与绘图软件,可绘制线性或环形DNA图
ANNHYB:用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件
RESTRICTION ANALYSIS:限制酶消化工具
ABIView:ABI格式文件显示与编辑软件
Chromas:ABI格式文件显示与编辑软件
Sequence viewer:获取与观察从GSDB获取的DNA序列数据及其关联特性的工具
DNAssist:DNA序列分析工具
DNAProbe:核苷酸序列设计工具
DnaSP:DNA序列种群遗传学分析软件
DFW:DNA分析软件
Artemis R4:以Java语言写成的序列查看工具 ’
ACT R1:以Java语言写成的序列比较查看器
GDA:主要用来进行不连续基因数据的统计分析
RDP:从一组排队比较(Align)的核酸序列中查找潜在的重组体软件
Sequencher:装配DNA小片段为大的连续序列或毗连(序列)群"Contig"软件
MehCalc:自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件
基因探索者:中文界面的功能集成、高效、快捷的基因分析软件
ConsInspector:DNA蛋白结合位点预测识别软件
MatInd与Matlnspector:快速匹配DNA序列与已知共有序列的软件工具
GBuilder:JAVA语言编制的用来分析与显示DNA序列的软件
GenomePixelizer:帮助理解基因组中的簇基因(C1ustermggene)之间的相互关系的软件
LabBook Genomic XML Viewer:图形化显示并处理GenBank序列数据的免费软件
Gene Construetion Kit 2 :管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件
Genalysis:比较基因组或大量基因序列的工具软件
3.RNA分析
RNAdraw:RNA二级结构分析软件
RNAstructure:预测RNA 级结构图
RnaViz:RNA二级结构图绘制程序
4.蛋白质分析
ANTHEPROT:蛋白序列分析软件包
pSAAM:蛋白序列分析软件包
VHMPT:螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件
aminoXpress:免费的多功能蛋白分析软件包