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主题：【求助】刚接触质谱的菜鸟想请教各位前辈一些问题！！！

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huanluoran
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发表于：2012/04/30 22:34:58 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
      我本来是学测控的，可是最近老师让我学习一下质谱的数据处理方法，不巧实验室的硬盘坏了，所以老师让我先用matlab仿真数据再编程序处理。以前都没接触过质谱，查了一些资料也没什么头绪，这里我先说说自己的初步想法。

      因为以后有对比不同算法的处理效果的问题，主要的步骤定为（1）需要根据标准谱图把几种物质的峰值集合在一个数据集中；（2）加上噪声；（3）用算法去噪；（4）利用数据库对结果打分。

      想请教各位前辈的问题是：（1）我看到有些谱图是离散的峰值有些是连续的，这是为什么呢,我应该选择哪种形式仿真呢？（2）数据处理是建立在蛋白质大分子基础上的，我应该如何选择合适的标准谱图？我也看了很多数据库，可是因为没有明确的物质名称，完全不知道该怎么差·····（3）加上什么样的噪声才符合实际情况的呢？

      这个题目没有学长指导我一个人乱看资料速度实在太慢了，恳请前辈们给我一些建议！！！！
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2012/5/2 12:17:34 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
现在常见质谱数据有两种格式，一种所谓的profile图(连续的)，一种是棒状图(离散的)。但原始数据都是profile图，也就是针对每个质合比，都有一个响应的信号强度。将这些数据点连成曲线，就是一个profile图。所以profile图占用很多硬盘空间。现在高分辨质谱，一张质谱图就1M以上。如果走液质连用，每秒就算10张图，1小时的梯度下来，就有1*10*60*60=3600M，这个数据是很可怕的。所以需要将数据转存为棒状图。棒状图就是在profile图中，每检测到一个峰(取决于信噪比等)，就保存该峰的分子量和信号强度。
对你的课题我不了解，但建议你在profile图上做文章
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huanluoran
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2012/5/2 22:56:26 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
十分感谢前辈的解答，我有点头绪了~
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liufeilzu
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2012/9/26 6:55:27 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
蛋白质都有数据名称啊，很多数据库可查，不过很多是酶水解后的片段
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