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主题：【讨论】求助！如何分析这个质谱图?判断其是不是我目的多肽

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yjihicvtkd
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发表于：2012/09/21 17:09:27 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
老师们，我现在做一个多肽的纯化，先是样品液过液相色谱柱，收集的峰拿去打质谱
但是对于图如何解析却无从下手！！

我的目标多肽是4726分子量，43个氨基酸，其中8个半胱氨酸，PI为8.5。
这是其中收集的一个峰打出的质谱图，大家帮看看怎么解谱呢？？？怎么判断是不是我要的多肽呢？

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yjihicvtkd
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2012/9/21 17:13:51 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
这个图有点大，我截成两段。
已知的是后面的922  1221 是参比峰

听说有根据多肽的电荷数来计算质谱峰的，如果电荷数为N，
      则  分子量/N +1=（质谱图中)m/z 

但是不知道如何确定这个多肽的电荷数呢？
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dark_wzy
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2012/9/21 17:32:25 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
应该去借助软件来分析吧。电荷数可以根据两个相邻同位素峰之间的质量差来判断，电荷数=1/质量差。
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yzulcl
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2012/9/21 19:00:29 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
看起来信号不够强啊。样品的信号不强，参比的922、1222也不够强。
TOF的信号要到10^5会比较理想，最起码要到10^4才够看。仪器没调好吧？
该帖子作者被版主 xgy2005加 2积分， 2经验，加分理由：交流
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maldiguy
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2012/9/22 6:55:29 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
一言以蔽之，从图中看不到你的多肽
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徐有才
xuox
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2012/9/26 7:34:07 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
是啊 你的信号太弱啦根本看不见啊～～
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chy57589893
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2012/9/26 8:52:40 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我也是感觉信号有些弱。从第一张图上基本看不出来有用的信息，LZ可以多做几张发上来，增加下信息量
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yjihicvtkd
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2012/9/27 20:57:09 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
谢谢大家！
仪器应该怎么样调呢？
之前做的质谱skimer  电压为65V，后来一个老师说电压大了，就调到了35V
还有一个问题，我把样品用C8柱子分离的时候，流动相  A相：超纯水加0.5/1000的TFA，B相：乙腈加0.5/1000的TFA  ，收集的峰去打质谱。  据说TFA会抑制质谱信号，这里面是不是抑制掉了呢？
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yjihicvtkd
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2012/9/27 21:01:59 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 dark_wzy(dark_wzy) 发表:
应该去借助软件来分析吧。电荷数可以根据两个相邻同位素峰之间的质量差来判断，电荷数=1/质量差。


真个学习啦！
有什么软件呢？可以推荐下吗？
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yjihicvtkd
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2012/9/27 22:00:55 9楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊


这个是我后来把样品冻干，然后用少量10%乙腈溶解后，纯化出来的一个峰打的质谱，大家再帮分析一下，谢谢啊
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happy爱米粒
xgy2005
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2012/9/28 20:10:58 10楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 yjihicvtkd(yjihicvtkd) 发表:
谢谢大家！
仪器应该怎么样调呢？
之前做的质谱skimer  电压为65V，后来一个老师说电压大了，就调到了35V
还有一个问题，我把样品用C8柱子分离的时候，流动相  A相：超纯水加0.5/1000的TFA，B相：乙腈加0.5/1000的TFA  ，收集的峰去打质谱。  据说TFA会抑制质谱信号，这里面是不是抑制掉了呢？


TFA对负模式影响较严重，慎用
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