主题:【分享】生物实验室那些事

浏览0 回复26 电梯直达
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11. 在把蛋白胶做成干胶时
很多时候会因为有气泡使胶裂掉,我的经验是在做胶时加上层膜前在胶上多加些水就不容易进气泡了,还有就是高温烘胶,我喜欢放到60度烘箱里烘,这样水分蒸发速度快,即使有一些小的气泡也不会有影响,呵呵,这是经验之谈,我从来都没失手过,大家可以试试。

12. 做大肠表达时
确定蛋白是否表达一般要煮样做诱前诱后检测,但很多时候煮出来的很黏影响跑胶效果.我发现如果现用8M Urea重悬细菌再煮效果会有极大改善。
注:不能用Gu-HCl代替。
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13. 我也推荐几个偷懒的方法
1.  做SDS-PAGE跑胶通常都是现配现用,但配胶要>1h,所以如果想第二天睡个懒觉而又不耽误跑胶可以于前一天晚上做好浓缩胶和分离胶,待凝聚后不要拔下梳子,把含胶玻璃板从制胶槽取下,用保鲜膜包上,注意玻璃板上下两边缘会有气体,所以需要加一点电泳缓冲液以避免胶内水分蒸发.然后放4度过夜.第二天直接拔下梳子行后续.国外好多公司出售脚既是如此,可以保存上星期。
2. 配置分离胶或者非变性胶时因胶凝时收缩可导致加样孔变浅.可以将加剩的胶放入4度以降低凝聚速度,而将凝胶放入37度促聚,并随时用4度加剩的胶补充下降的胶面.另外将胶横放与水平面成~10度角也可以减少收缩的影响。
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3.推荐一个节约抗体/时间的做法:
同时跑2块胶,同时转膜,然后两块膜背靠背放入同一封口膜同时封闭,同时一抗二抗(最好是用转轮,这样效果好.如果是摇床,隔一段时间帮它们翻个身以保证两张膜的正面都有机会与液体充分接触.一起洗膜(可以稍微加强洗膜也可以不做.我最多一张盘子里放4张膜而没有影响洗膜).可分别或同时压片.这样就可以节约一半抗体和接近一半时间而不会影响结果。
或者另外一个就是孵育后的抗体不要扔,好的抗体可以反复做好几张膜呢.但每次都会减弱,效果不如上面一种方法。
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14. 做western blotting 转膜时
胶放在转膜缓冲液中一段时间,待胶在含有甲醇的缓冲夜中缩小的差不多后装
好转膜装置,我的经验是把膜印在胶上直接在膜上画出预染maker条带,方便的很。因为很多时候跑电泳时胶上的预染maker很清楚,等转膜后就不是分辨的很清楚了。不过要注意画好预染maker后就不要使胶和膜发生对位移动了,以防maker失去参照价值。
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15. 超滤最合适用于蛋白的浓缩,
更换缓冲液和除盐,对于按照分子量进行初分离的效果不是很好,理论和现实是有很大差别的。

16. 关于Western Blot
1)器具的清洁非常重要,开始做前,为了安全,尤其是装胶的厚薄玻璃板,可以先用中性洗涤剂和自来水反复冲洗,确保无洗涤残液后用蒸馏水冲洗2-3遍,然后用去离子水冲洗一遍。最后用95%酒精再擦一遍后晾干备用。
2)配胶最好现用现配,先配下层胶(分离胶),后配上层胶(浓缩胶或积层胶),而且在临灌胶前加APS并迅速混匀,即用移液枪抽吸与注入1-2次即可。
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17 跑蛋白page的时候
一开始用加样针,太麻烦,发现用20ul枪+普通小白枪头点,非常省事。另外,点样时有可能看不清孔在哪,看远离你的那面胶,孔有反光的。点样也点你对面的那块胶,省的总低头,干咱这行的容易得颈椎呀,爱惜自己。

18. 垂直电泳时,
可在电泳糟中放入青霉素小瓶等,可自然使液面提高而不影响电泳,又很节约电泳缓冲液。
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19. 我们有时要沉淀东西时,
由于沉淀量很少,离心完之后不知道到底有没沉淀下来东西,由于量很少,不好观察,所以离心时建议按特定的方向放置离心管,这样你就可以在离心之前确定沉淀该沉淀到管子的大致部位,这样离心后就可直接观察那有没有沉淀,避免满管子找,另外看沉淀时可以对光看,这样就是颗粒状的细小沉淀也能看见的。

20. 大家都知道PMSF有剧毒,
以前都是知道浓度和要配的体积的基础上,算出要称多少毫克的PMSF,其实也可以先称PMSF,称多少算多少,再调整异丙醇的体积,到达你所要的浓度。这样就避免了你长时间和它接触。
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21. 跑好SDS-PAGE胶的一些体会:
1. 清洗好玻璃板,不要偷懒,很多时候跑完电泳撬胶时会因为玻璃板不干净胶粘在板上把胶撬破。
2. 配胶时不要反复用枪混,稍微摇混就可以了,用枪混多次会导致胶凝不好影响电泳图的分辨率。
3. AP分装成500微升一管保存放-20度,避免AP用太久失效。
4. 倒胶时把玻璃板中的水用滤纸尽量吸干,因为微量的水存在会影响配的胶浓度。
5. 尽量不用过夜放室温或者四度的胶,也回影响胶 的分离效果。
6. 电泳完撬胶时根本不需要用撬胶板,在一平皿里装好水,把有胶一面的放在水中晃动几次胶很容易就脱落下来,一点没有问题,方便的很。
7. 点样时样品别忘了离心这步,因为上样含有固体沉淀会影响电泳图分辨效果。
8. 尽量在冰浴状态下跑。
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22. 关于2-DE
总结了几个小窍门:
1.一向电泳时,盐离子容易聚在 胶槽的两侧.剪一小段IPG胶条放在两侧,构成盐桥,电压就容易上去了。避免一向电泳不好影响最后实验结果。
2. SDS-PAGE时,在灌胶之前,一般大家都会用凡士林封底, 在SDS-PAGE电泳之前又必须把凡士林搽干净,很是麻烦,我的经验是:不用凡士林,取少量未加Ap的分离胶,按比例加2倍量的Ap,然后灌入板间,等上几分钟,待胶凝固后就可以接着灌分离胶方面,效果好!
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23. 蛋白质纯化时
蛋白质降解可能与超声破菌保持冰浴有关,之前建议加pmsf,建议在上柱子洗脱的时候也加pmsf(蛋白降解抑制剂),一定要用之前再加。

24. 做透析的时候,
拿一个5ml的枪头或者是其他类似的东西,剪短,穿过个塑料泡沫之类的面积比烧杯大东西,然后把透析带一端扎紧,另一端开口绑紧在5ml枪头下端,扎紧得那端也可以弯过来绑成u字型。这样就可以用1ml的枪穿过5ml的枪头的孔,另一只手调整透析带,来加样取样,省去了总绑透析带的麻烦,对同一个蛋白大量多次透析非常方便
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