主题:【原创】质谱图很难以检索例子2

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质谱图很难以检索例子2



这两天看到一位网友发帖求助未知物定性的帖子气质联用测定酒香气物质匹配度大部分都很低。讲气质联用测到的数据比对数据库后,百分之八十的匹配度都很低,大部分只有二三十,而且还都不是香气物质。用的是赛默飞的机器,用的Xcalibur软件分析的,NIST谱库比对的。大致看了一下,发现扫描范围起点过高,从m/z50离子开始,低质量离子丢失使一些化合物的关键离子没有而使检索匹配度很低,根本无法进行普库检索。后来另外发现又发现一个致命的问题,就是采集到的质谱图由于样品过载而严重失真,更造成利用谱库检索来定性里面的未知物的难度,匹配度极低或根本无法检索。还有就是固相微萃取萃取头的流失较大,也有一定的干扰。总离子色谱图(TIC)如下:



图1  总离子色谱图(TIC)

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其中20.062,24.012,24.358,28.196min大峰等是硅氧烷来自流失,可以不考虑。积分峰数也比较多。前面的峰较宽,不知道是否没有使用固相微萃取专用衬管而引起。初步看来一下,几乎无法检索匹配,感觉很难,几乎难以下手,开始只好放弃。感觉对于这个不是成功的数据采集束手无策,似乎是个无解之题。

先用amdis质谱解卷积软件试试看。下面是amdis的图谱:



图2 Amdis图谱

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从Amdis的图谱可以看出,解卷积的点(峰)还是比较多,但匹配度仍然低于正常情况。

1 先看看第一个2.255分钟的宽峰,解卷积显示有glyceroL,也有ethyl acetat的可能。反向匹配度在80以上(参图2)。利用PBM检索的情况如下:




图3 PBM检索2.255min峰



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可以看出了,根本无法检索,无法匹配,无法得到结果。但根据amdis的解卷积解析提示,有甘油和乙酸乙酯的可能。现在仔细对照一下未知峰和甘油及乙酸乙酯的标准质谱图如下:




图4 2.255min未知峰谱图及解析的可能性



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通过对比,可以看到2.255min未知峰质谱图里面有甘油的m/z61,60,61等离子,可惜由于扫描范围不合理,看不到m/z43, 44, 43等离子。另外乙酸乙酯的m/z61, 70, 73, 88离子也可以看到,可惜同样看不到m/z43, 45等离子。

2. 看看3.738分钟,PBM检索还有点可以,检索为异戊醇,但匹配度还是比较低,同时用Amdis处理也证实有异戊醇。



图5PBM检索3.738min峰



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3. 7.160分钟峰用PBM检索根本是一团乱麻。用amdis看看可能有乙酸异戊酯。后来对照此未知峰和乙酸异戊酯标准图谱,有m/z55,61, 70, 87等离子,但可惜损失了m/z43等离子。

4. 用同样的方法11.055分钟未知峰里面有己酸乙酯。

5. 对于14.448分钟,直接点击封顶,无法得到正常的质谱图,过量了超载了。



图6 14.448分钟未知峰的质谱图



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尾巴14.54分钟点击还可以得到正常质谱图,但由于超载而根本检索,同样问题。Amdis帮忙看到是苯乙醇。对比标准质谱图,未知峰有m/z91, 92, 51, 65,122等离子。真不容易。

6. 16.435分钟同样也是非常难以检索。用同样方法看出是diethyl succinate。

进样过量而引起的未知峰各个离子比例失真,因而给检索造成问题,无法用一般正常的PBM谱库检索来得到满意的结果。

篇幅关系,其它未知峰就不累述了。

小结:

1 在实际测定中,需要注意进入气质样品量不能过大,以免引起离子比例失真或严重失真,导致谱库检索困难,匹配度过低,或者甚至无法进行谱库检索的情况,就像本文中提到的这种情况。

2 对于低质量离子或高质谱离子也要注意,不能丢失或未采集到。例如设置不合理的离子扫描范围,漏掉某些离子。同样会造成匹配度差,谱库检索效果不佳的情况。

3. 在万不得已的情况下,借助其它软件帮忙来解决某些普通检索难以解决的难题。
该帖子作者被版主 inssyc10积分, 2经验,加分理由:原创文章
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原文由 yayicuo(v3253952) 发表:
写的不错,值得学习
已经更新完毕,欢迎批评指正。
泤影
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我的看法还是跟上次一样,再进一针,(制备样品多预留些)更改合适的分流比,更改合适的色谱条件(分流/减少进样,调整程序升温条件/更换合适色谱柱,让可能的峰尽量与杂峰分开),再着合理运用解卷积或者扣除背景的你方式提高检索匹配度
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原文由泤影(p3327076)发表:我的看法还是跟上次一样,再进一针,(制备样品多预留些)更改合适的分流比,更改合适的色谱条件(分流/减少进样,调整程序升温条件/更换合适色谱柱,让可能的峰尽量与杂峰分开),再着合理运用解卷积或者扣除背景的你方式提高检索匹配度
能进一针更好了,但问题是当时这位是疫情前做的样品,疫情期间无法回到学校实验室再做样,又需要毕业完成论文。
泤影
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:能进一针更好了,但问题是当时这位是疫情前做的样品,疫情期间无法回到学校实验室再做样,又需要毕业完成论文。
那没办法,他这种实验才到一半或者一半都没到的,完成毕业论文只能再想其他办法把实验做完,就算你解析了这图,对整个毕业论文来说还是远远不够的呀
symmacros
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原文由 泤影(p3327076) 发表:
那没办法,他这种实验才到一半或者一半都没到的,完成毕业论文只能再想其他办法把实验做完,就算你解析了这图,对整个毕业论文来说还是远远不够的呀
也许解析了这图什么用处都没有。那个讨论话题仅仅是探讨采集数据不好的时候可能应对补救的办法,讨论一下,不是求助帖,不必太认真。谁都知道如果能重新做一次,什么事情都没有了。
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2020/9/16 9:22:54 Last edit by jimzhu
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原文由 yifan1117(yifan1117) 发表:
看来要把握好进样量。
是的,进样太少,灵敏度不够,检测不到,进样量太高会过载质,谱图失真。
yifan1117
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
是的,进样太少,灵敏度不够,检测不到,进样量太高会过载质,谱图失真。
恩,需要摸索,比较。
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