在一定的压力下,鞘液带着细胞通过喷嘴中心进入到流式照射室,在流式照射室的分析点,激光照射到细胞发生散射和折射,发射出散射光(包括前向散射光和侧向散射光);同时细胞所携带的荧光素被激光激发并发射出荧光。
前向散射光(Forward scatter, FSC)和侧向散射光(side scatter, SSC)检测器把散射光转变成电信号。而荧光则被聚光器收集,不同颜色的荧光被双色反光镜转向不同的光电倍增检测器,把荧光信号也转变成电信号。这些电信号再经过数据化处理后输入电脑并储存,即可对细胞进行分析或分选。