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同位素及其它无机质谱

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主题：【求助】电喷雾质谱能用来检测DNA的加合物吗？

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fujieyou25

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发表于：2007/04/11 21:01:00 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

请教各位大哥，质谱可以否用来检测25bp以下的DNA，我的质谱是ESI-MS ，m/z=50-2200，能否用来分析检测DNA的加合物，打概用什么溶剂比较好？PH为多少合适？谢谢~！

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2007/4/14 19:33:00 沙发管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

怎么没人出来支个招啊？？？

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ruirao

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2007/4/20 9:59:00 板凳管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

您所谓的加合物是指以非共价键的方式形成的复合物吗？
如果是的话，ESI可以做，而且结果还很好，要注意毛细管的温度，此外，对于DNA样品，要尽量的脱盐。

您还可以搜索这一领域的文章，首次发表在JACS上，具体那一期我忘了。

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ruirao

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2007/4/20 10:02:00 马扎管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

25bp以下的可以做，2000以下出现多电荷峰，用来研究复合物没问题。
溶剂：水就不用说了，重要的是要加入甲醇，20％左右。
PH值：7左右。

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fujieyou25

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2007/4/22 9:34:00 地毯管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

谢谢大家的不吝赐教，但是我做了几个样，没有得到稳定的质谱峰，有没有那位大虾帮我传上点相关文献上来呀！？

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Last edit by fujieyou25

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2007/4/29 14:32:00 地板管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

我也曾经试过12bp的DNA,也是想做弱相互作用的研究，但是用ESI-MS没有做出来，但我们的量极少，只有几个OD，所以我怀疑当时是量太少的问题。请问你的用量足够吗？若量够的话，做负离子检测应该可以做出来吧？

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2007/4/29 16:28:00 6楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原文由 caosx 发表:
我也曾经试过12bp的DNA,也是想做弱相互作用的研究，但是用ESI-MS没有做出来，但我们的量极少，只有几个OD，所以我怀疑当时是量太少的问题。请问你的用量足够吗？若量够的话，做负离子检测应该可以做出来吧？

你问的是浓度足够大吗？我用的是50mg/L的DNA，用水直接配做了，用碳酸铵缓冲溶液配置也做了，听说加20%甲醇会效果好点，我也试过了，但就的没有好的结果，请问着位仁兄还在做吗？可以相互讨论一下

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lisq

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2007/6/2 10:55:00 7楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原文由 fujieyou25 发表:
请教各位大哥，质谱可以否用来检测25bp以下的DNA，我的质谱是ESI-MS ，m/z=50-2200，能否用来分析检测DNA的加合物，打概用什么溶剂比较好？PH为多少合适？谢谢~！

刚做了一个DNA的样品，分子量接近3000，谱图还不错。以前同学送过一次，量很少，我用MALDI做的，没有信号。这次浓度很大，他用水溶好的，我直接加了2倍的甲醇进去，用ESI做的。从谱图上看，稍微有点浓，不过觉得做DNA样品浓度大点好，因为表现的是峰簇，谱图局部放大后，看起来就很好。另外解离电压要低点。我用的是FT ICR MS，灵敏度要高一些。

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