液质联用,即将液相色谱(HPLC)的分离功能与电喷雾质谱(ESI-MS)的检测功能结合起来,用于对蛋白质或者多肽的混合物进行高通量的自动化分析。蛋白质酶解产物或者多肽混合物根据其性质,通过液相色谱分离后,经电喷雾技术离子化以后进入质谱进行MS 和MSMS的分析,最终通过数据库搜索得到定性定量信息。
为了得到更好的蛋白质多肽分离效果,常会利用其不同的性质进行多维色谱分离(MudPIT),比如最常用的阳离子分离和反向色谱分离联用技术(SCX-PRLC),再通过质谱分析,从而鉴定到更多低丰度的蛋白质,实现更多低丰度蛋白质的检出。
目前市场上较为主流的液相色谱主要有Agilent,Waters,Shimadzu,Microm几家,电喷雾质谱主要有Thermo 的LTQ及其衍生的LTQ-Obi trap, ABI的Q STAR,Bruker的HCT,Waters 的Q TOF,以及Agilent的6500等。