CNVseq(Copy Number Variation sequencing)是一种利用低深度全基因组测序技术来检测染色体拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)的方法。这种方法可以一次性分析23对染色体的非整倍体情况以及大于100 kb的染色体拷贝数变异,对于一些微缺失或微重复综合征的诊断特别有用。
CNVseq技术的特点包括:
- **分辨率高**:相较于传统的核型分析,CNVseq能提供更高的分辨率,可以检测到更小的变异,比如小于100 kb的CNV。
- **检测范围广**:不仅可以检测染色体数目异常(如三体、单体),还能发现微小的染色体重排(如微缺失、微重复)。
- **报告周期短**:一般情况下,从样本接收至报告交付仅需3到5个工作日,这对于临床诊断来说是一个很大的优势。
- **PCR-free**:在构建文库的过程中,采用减少PCR扩增偏好的方法,从而使得测序数据更加真实地反映原始样本的情况。
- **数据质量高**:确保了较高的测序质量,例如单端reads数目超过5百万,原始数据Q30大于85%,过滤后的数据Q30大于90%,并且全基因组覆盖度大于0.1X。
CNVseq的应用领域包括但不限于:
- **产前诊断**:用于检测胎儿染色体异常。
- **新生儿筛查**:帮助诊断出生缺陷和遗传性疾病。
- **肿瘤研究**:分析肿瘤样本中的拷贝数变异,了解肿瘤发生发展的机制。
- **疾病研究**:识别与特定疾病相关的微小染色体区域,有助于理解疾病的遗传基础。
总的来说,CNVseq是一种强大的工具,它可以帮助研究人员和临床医生更精确地识别和理解染色体异常所导致的各种遗传疾病。