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略谈实验室信息管理系统的设计(LIMS)及在企业的实现

               
郭强 杜燕臻



(济南钢铁公司技术监督处 250101)


  摘 要:以一个实例简要介绍实验室信息管理系统(LIMS)的产生、发展、企业建立LIMS的作用,以及建立LIMS系统的基本设计思路。
  关键词:实验室、信息管理系统、LIMS

  计算机技术的进步,促使现代工业技术在快速发展,随着科研和生产技术的不断发展,企业的检验技术也从手工分析发展到仪器分析,检验项目大量增加,对数据的准确性和报出时间的要求越来越严格,数据处理量急速增加,原来的人工管理模式在这种形式下已显得不太适应,使用计算机完成数据的收集、分析和处理的管理手段应运而生。在这一背景下,实验室信息管理系统(LIMS)开始出现,并在实际应用中得到了快速发展,成为一项崭新的实验室管理与应用技术。

一、实验室信息管理系统(LIMS)简介
  实验室信息管理系统,即LIMS,是Laboratory Information Management System的缩写,它是指通过计算机网络将实验室的分析仪器连起来,通过建立以实验室为中心的分布式管理体系,根据科学的实验室管理理论和计算机数据库技术,建立完善的质量保证体系,实现检验数据网络化共享、无纸化记录与办公、资源与成本管理、人员量化考核,为实验室管理水平的整体提高和实验室的全面管理提供先进的技术支持。
  LIMS技术应用比较广泛,适用于各行业的分析测试实验室,作为成熟的产品在许多发达国家已经得到了广泛的推广与应用。专业单位设计、功能全面的LIMS软件在国内部分比较大的石化行业和地质行业的检测实验室已经有实际应用,而根据自己的实际特点自行开发设计的、具备简单数据管理功能的小型LIMS软件,也早已在各单位的实验室得到了大量应用。

二、 LIMS的分类:
  根据其功能,LIMS一般可以分为两大类:
  第一类:纯粹数据管理型
  这类的LIMS软件主要功能一般包括:数据采集、传输、存贮、处理、数理统计分析、数据合格与否的自动判定、输出与发布、报表管理、网络管理等模块。这些功能满足了实验室检验工作的基本需要,功能比较单一,因而计算机网络结构一般比较简单,但比较容易实现,投资比较少,设计好后,一般可以在较长的时间里不需要对网络软硬件进行改变。实验室可以不配备或是配备比较少的计算机网络与数据库维护人员。在计算机应用广泛普及的今天,许多单位自己就可以设计这种软件。
  第二类:实验室全面管理型
  除了第一类的功能外,这类LIMS软件与网络一般还可以增加:样品管理、资源(材料、设备、备品备件、固定资产管理等)管理、事务(如工作量统计与工资奖金管理、文件资料和档案管理)管理等模块,组成一套完整的实验室综合管理体系和检验工作质量监控体系,除了能够实现对检验数据严格管理和控制外,还能够满足实验室的日常管理要求,功能比较全面,网络结构相应要复杂一些,实现起来要困难一些,投资比较大,而且,往往需要专业单位与实验室合作开发设计。另外,由于实验室的机构设置、职责、管理思路和其他特点可能会随着时间的改变而发生变化,可能需要经常对网络软硬件进行改变。因此,实验室一般需要配备专业的维护与再开发技术力量。如果所用软件与网络结构是其他单位帮助设计,则可能需要支出较多的资金。目前,国际上和国内都有此类商业软件销售。相对而言,国内软件开发商在软件的设计上与国外技术相比还有些差距。在一些国内专业刊物上有相关软件介绍。

三、LIMS技术的发展
  LIMS发展至今,大体经历了以下以个阶段
1、雏形期:60年代末期-70年代初期
  这一时期是LIMS设计思想的产生时期,实验室的数据管理仍然停留在手工记录阶段。
2、商品化时期:70年代中期-80年代末期
  这一时期的LIMS系统操作一般集中在中心计算机上完成,可以实现一般的数据管理与统计分析功能,数据处理能力比较小,手工处理的工作量仍然比较大,其它功能还没有实现。这个时代的计算机语言和网络技术还不够发达,计算机的价格比较昂贵,需要专业的技术人员编写与维护程序。
3、功能完善时期:80年代末期-90年代中后期
  伴随着这一时期计算机技术的飞速发展,LIMS技术进入一个崭新的发展时期。此时,计算机(PC机)价格开始大幅度下降、而性能却大幅度提高,基于第三方的关系型数据库技术与网络技术已经成熟,系统一般采用PC作为数据终端,网络体系的建立比较容易。C/S构架的数据管理模式成为主流,数据处理能力大大提高。由于实验室规模一般都不大,随着MS Windows、Windows NT操作系统的兴起,基于该平台开发的LIMS开始流行,LIMS开始从DOS平台、UNIX平台逐步过渡到Windows、Windows NT平台,这个时期的产品一般都具有良好的用户界面,操作比较简单,功能比较全面,性能价格比较好,吸引了越来越多的用户。由于新一代数据库和面向对象设计软件的大量涌现,通过简单学习,一般技术人员也可以象专业技术人员一样采用面向对象编程技术简单设计数据管理软件、建设结构简单的网络。
4、网络化产品的兴起:90年代后期-21世纪
  90年代后期,Internet技术以令人不可思议的速度飞速发展,各行业均被卷入了互联网的大潮之中,网络技术的应用遍及各种工业技术当中。新一代的数据库设计与网络设计都或多或少带上了Internet的特点。采用Internet 、Intranet和Web技术的LIMS开始出现,普遍采用了统一的浏览器界面和以Web服务器为中心的分布式管理体系,使用极其方便,数据的共享和发布更为简单,功能更为全面,软件的二次开发更为容易,这些最新的计算机网络技术在LIMS系统中的应用,代表了今后LIMS技术的发展方向。
  LIMS技术的使用可以带来许多显而易见的效益,比如:
  自动进行数据审核和超标数据监测、提高分析数据的准确性;工作效率大为提高;降低实验室成本消耗;通过对大量样品数据的综合统计分析,可以清楚地观察到数据的变化趋势、有效监测产品质量,为解决出现不合格生产产品及生产工艺变化提供科学依据。借助计算机技术,实验室内部实现网络化全面管理,实现管理和检验工作的有效监督管理,提高整体工作水平。
  虽然有这么多多的效益,目前还有不少单位对此技术的应用不重视。

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四、LIMS的设计特点
  适应现代化企业发展的的实验室必须要建立起完备的质量管理体系,因而需要一套科学的LIMS软件,它应既能满足目前的业务状况,又能适应未来不断增长业务需求,具有灵活的可扩充性。因此,大规模的LIMS软件技术,往往要在经验丰富的实验室管理人员的协助下,集多位计算机专业人员共同开发设计而成。
  根据国内外优秀的LIMS技术应用的成功经验,可以总结出近几年设计的LIMS具备以下几个最基本特点:
• 技术上具有先进性、高效性、实用性、安全性;
• 数据管理功能完善,数据的采集、处理、发布过程中不会出现数据丢失、改变的问题;
• 界面友好,操作简便,使用Web数据库技术和统一的浏览器界面;
• 自动化程度高,网络结构设计简单;
• 模块化设计,易于扩充功能;
• 符合ISO/IEC导则25的规范要求,符合实验室管理特点;
• 投资少,最大限度保护用户的投资;
• 产品设计灵活,客户化周期短。

五、LIMS的组成模块与设计
  各种LIMS的实际设计技术和特点差别较大,但基本的设计思路与原理比较一致。下面结合某单位下属部门一个小型LIMS设计工作,谈一下LIMS的实际功能模块设计。各单位应根据实际条件、经济能力,按照经济实用的原则来设计。
  本例是某单位下属的一个小化验室数据管理LIMS。该单位的实验室比较多,地理位置也比较分散,目前采取先建立小规模的局域网,条件成熟时再移植、连接、统一成一个大的区域网。本例的实验室距离其他实验室较远,因此,现在的设计工作,以数据管理与报表自动生成功能为主,既要满足向生产单位及时发布数据的要求,也要考虑到今后网络统一的要求,并且适当照顾到实验室的全面管理,以及实验室国家认可工作的需要。
  涉及到的主要仪器是ARL 4460直读光谱仪和ELTRA CS800红外碳硫仪,同时考虑到人员量化考核功能的实现,利用单板机,设置了样品接收时间自动捕捉功能,并将数据送到管理机中。
1、仪器接口模块:
  作用是将分析仪器直接与计算机连接起来,通过专业化的软硬件接口技术,实现分析数据的短距离或远程自动采集,并保存到数据库中。
1) ARL 4460直读光谱仪:该仪器的操作软件生成的数据格式比较特殊,但利用ARL COMPAC协议和RS232接口通讯方式可以产生并主动传输等多种标准格式数据文件,采用的都是标准"握手应答"的传输方式,因而管理机从仪器控制机读取数据比较容易,不需要编写复杂的程序,数据传输过程中不会出现丢失、错误等问题,要好于采用发送/采集后不管的数据采集、传输方式。。
2) ELTRA CS800红外碳硫仪。
  该仪器的软件可以自动生成标准格式文本文件。我们采取了管理机主动读取数据的方式,数据读取软件比较容易编写。采用RS232接口通讯。
3) 样品接收时间捕集
  利用普通单板机实现,VB语言实现此功能。
  对于有些仪器,由于软件版本较低、或者是软件数据格式特殊、或者是不具备/不支持标准数据协议、或者是不支持主动传输等原因,需要对数据文件结构进行分析,按照一定的协议,编写主动读数程序,有时还可能因为如串口故障,采用并口取数等技术,以往一般多采用C语言或是汇编语言编写,但由于要掌握这两类语言比较困难,近年来采用VB、Delphi等语言实现此类功能逐渐流行起来。如,VB语言提供了MSCOM控件,仅编写少量代码即可,较使用C语言大为容易。
  另外,现代化的大型仪器往往对工作环境如温度、湿度要求比较严格,可以利用电子仪器自动采集这些数据送往管理机。
2、数据管理与统计分析模块
  这是LIMS的核心部分,一般按照数据库方式设计。在主控模块下,包括数据输入、数据审核、数据处理、统计分析、报表生成、远程传输等全过程,另外可以根据需要,随时挂接其它管理模块。基本实现了数据管理与质量控制功能。
  在Web浏览器形式的用户界面上包括了数据浏览、数据固定查询、自定义查询、固定格式/自定义格式报表生成、固定方式/自定义方式数理统计、数据导出(到纯文本格式文件、Ms EXCEL格式文件、HTML格式文件等)、样品分析时间查询、工作量查询、产品标准成分数据录入、分析数据人工录入(必要的备用功能)等菜单按钮,这些子模块的软件编写比较容易。通过简单点击即可进入相应的功能子模块。按照实际工作需要,确定以下的数据接收与管理流程:





  管理机在接收到分析数据后,数据库自动按照产品牌号的关联关系与产品标准成分库的数据内容逐个成分对照检查,对不符合的元素在数据库中、计算机屏幕上、报表、远程传输等过程中均立即予以醒目标识。
  在此模块中,根据需要还可以集成如标准物质、控样管理功能、任务调度功能等。图表输出功能通过调用Ms Graph.ocx控件实现,也提供了数据输出到MS EXCEL软件作图的功能。
3、数据发布模块
  目前是利用远程传输的方式向生产现场实时传送数据,传输距离约为300米。根据传输距离的不同,可以采用其他的实时传输方式。必要时,可以通过建立LIMS内部Web服务器,利用企业的Intranet实现更大范围的信息共享和数据发布。
4、事务管理模块
  对实验室的事务性工作进行全面综合管理,包括人事、仪器设备、材料与备件、文件、工时统计、财务管理等方面。在此实验室,这些子功能目前暂不实施,但这些功能比较容易编写软件。在该单位其他实验室的LIMS建设过程中,基本考虑到了这些功能。由于整个软件按照模块化的思路、采用Web数据库和统一浏览器界面的方式设计,今后可以由系统管理员根据需要在主控菜单中随时挂接这些子功能模块。
5、系统与平台
  基于Windows操作系统,由于仅局限在较小的地理范围内,为便于今后实验室内部自行维护,采用了大众化的数据库语言MS V-FoxPro 6.0(VFP)软件设计了管理机数据库,通过利用SET TEXT语句、将超文本语言插入VFP语句中,实现了Web方式的界面。今后本实验室并入大网络时,可以移植到标准的SQL数据库,也可以利用现有软件、硬件结构简单对接。
  对于规模比较大、功能比较全面的LIMS,一般采用能够支持Oracle、Sybase和SQL Server工业标准的SQL数据库、Power Builder语言或者Ms VB 6.0语言、结合ODBC数据接口设计前端数据管理功能,利用浏览器作为用户界面,通过建立内部Intranet体系结构和Web服务器实现更大范围的数据共享。而新近出现的一些LIMS,则大量了采用了ASP、ActiveX、PHP技术设计网络数据库,特别是由于MYSQL软件具有免费、功能全面的特点,大有取代前述几种数据库的趋势,这类LIMS更像一个专业化的数据处理与事务管理网站。
  本例中,管理机兼作服务器,采用一台Intel Pentium ⅢCPU的计算机,用来进行数据管理和传输,确保系统数据完整和连续不间断工作。而对于整个实验室的大型区域网络将来采用专用服务器,利用公用电话线采取拨号方式进行远程传输数据,而往生产现场的数据传输仍然采用实时传输方式,部分条件较差的单位,采用了无线传输的方式,生产现场采用了大字体LED显示方式,也有采用微机中端,进行物料平衡计算的。
本实验室的小型网络采用了星型的网络结构。
  可以看出,对于仅要求数据管理与传输功能的LIMS,设计技术并不复杂,投资也比较少,维护简单,一般实验室完全可以实现。对于大型LIMS,则首先需要与用户共同进行详细的规划设计。

六、结语
  LIMS技术的应用,将会大大提高实验室的管理能力和检测、校准水平,提高工作效率。但各单位应根据实际情况灵活设计,不能照搬其他单位的设计模式。
  在实验室中使用LIMS技术,是企业检验实验室的必然发展趋势,将会给实验室管理和工作质量控制产生较大的效益,是遵循国际标准质量管理方式的实验室必备的管理系统集成产品。希望LIMS技术能够引起我国的实验室管理人员的重视,跟上现代工业技术的发展步伐,也祝愿我国的科技工作者能够及时跟踪国际LIMS技术的发展,开发出功能更为强大、性能更为优异的国产LIMS软件。
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