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核磁共振技术（NMR）

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主题：脯氨酸的化学位移

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liusky

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发表于：2005/06/16 05:23:00 楼主管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

脯氨酸的化学位移
proline有cis和trans两种形式，请问大概化学位移有什么不同啊。比如α氢等等。

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2005/6/16 8:21:00 沙发管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

ca.3.74ppm(D2O,PH=7.0时).
不同的PH值时,amino acid的化学位移是不同的.

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sslin

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2005/6/26 2:22:00 板凳管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

原文由 liusky 发表:
proline有cis和trans两种形式，请问大概化学位移有什么不同啊。比如α氢等等。

1. Proline 应该称 D,L 型或 R,S 型, 在对映体中 CH 的化学位移应是相同的.
2. 中性结构 NH/CO2H 时 ChemDraw 的预测为 3.62 ppm; zwitterion (NH2+/CO2-) 形式时 ChemDraw 的预测为 4.43 ppm.

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liusky

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2005/6/27 6:47:00 马扎管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

我想大家大概误会我的意思了。
在成为肽键之后，由于肽键无法自由转动，脯氨酸的环可以指向不同方向而成为顺反异构。对于同一个L或者D的脯氨酸来说是仍然可能有两种不同构型的。

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celan

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2005/6/27 11:18:00 地毯管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

下面是您在一楼的发言:脯氨酸的化学位移.proline有cis和trans两种形式，请问大概化学位移有什么不同啊。比如α氢等等。

您没有说明是肽中的proline啊!
肽中结合的proline,当然和单体不同,还有环肽中的proline.

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2005/6/27 11:25:00 地板管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

有机化学网有机波谱讨论过这类问题,你可以去看看.给你一个当时讨论的帖子.上面有结构式和化学位移.看对您有没有参考价值.

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celan

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2005/6/27 15:35:00 7楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

下面的结构和数据是我根据该化合物(天然)的1D,2DNMR解析的,供参考.方框和椭圆中的自旋系统已由图谱证实.

PROLINE环上的两个CH2化学位移分别是:1.85/2.34;
3.59/3.53;
同碳上的H化学位移不等价.

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celan

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2005/6/28 19:06:00 8楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

liusky,给您的数据有用吗?怎么不说话了?

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liusky

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2005/6/29 7:12:00 9楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

是的，从很多脯氨酸的NMR来看，他的同碳上的两氢是不等同的。由于现在做的一些大环肽化合物，其中某些脯氨酸H的位移大大脱离了正常范围，只是猜测是不是一些脯氨酸在这些大环中出现了顺反异构。当然理论上顺反异构是可以从NOESY判断出来的，不过分子过于复杂，TOCSY，NOESY的crossing peaks太多，以前用的500MHz的仪器峰的重叠很严重，现在用700之后可以区分峰的归属，但是判断顺反仍然不足。如果有一些肽中脯氨酸顺反异构的化学位移文献做参考就方便多了。

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2005/6/29 7:26:00 10楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

我看到的含有PROLINE的环肽的文献还是很多的呀,相当一部分是天然的,结构做的很细致.
看来你还需要查阅文献.根据你的条件,有一天时间足够了.至于把文献吃透可能要多花一点时间.

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2005/6/29 21:51:00 11楼管理分享倒序浏览只看楼主回复私聊

Many proteins contain, besides prolines in trans configuration, occasionally also proline residues whose conformational equilibrium is shifted to the cis configuration. Studies of these equilibria as well as the influence of cis/trans isomerases are usually performed with peptides as model systems. Using one- and multidimensional proton spectra, or P-NMR, the equilibria ratios can be determined under various experimental conditions. Of special interest is the influence of the isomerases on the protein folding process, which plays an important role in the molecular recognition of biolocially active conformations.