主题:【第二届网络原创大赛】浅谈代谢组学研究平台的建立

浏览0 回复29 电梯直达
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MandyCheng
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原文由 小猪飞飞(zpf20031212) 发表:
我也是用的Aquity BEH C18,用过一段时间之后柱压确实会上升,大概在7000~8000psi,因此还可以接受。仪器的重现性确实很好,我重新分析近两个礼拜的样品,响应几乎没有变化。这个比我用的四级杆好多了(也是waters的)。

当然,下一步会根据实验进行必要的前处理,包括你所提到的稀释,等等。

此外,每次做完实验,尤其是像这种样品前处理较简单的,最好要长时间冲洗柱子,必要的时候加上0.1%的醋酸、柱温高些,防止蛋白堵柱子。

如果单纯是尿液的话,一般正常尿液中仅含微量蛋白质的吧?不过前处理简单的话,真的要多冲下柱子才行。
小猪飞飞
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原文由 speleers(speleers) 发表:
分析技术只是为代谢组学研究的发展提供了一个良好的平台,但如何有根据的设计试验才是关键。不是说,随便比较一下生物样本的代谢谱就是代谢组研究了,我们要走的路还长着呢


的确,虽然代谢组学的后期数据处理及物质的鉴定是一个庞大的工作。但是实验设计的合理性和样本信息的准确性是基础。
netsking
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小猪飞飞
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原文由 netsking(netsking) 发表:
请问楼主是用什么软件进行PCA分析的?

仪器自带的masslynx;SIMCA-P
gancaosuan
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我做中药的代谢组学相关实验,采集的尿液LC-MS图谱中有很多中药成分及其代谢产物的离子,在进行PCA分析时,如何把这些药源性离子扣除,而只对内源性物质进行PCA分析?
work037
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能不能具体说下,你使用的数据处理软件是Waters自带的软件吗?如果不是你是如何导出数据,用什么软件处理的?
hhfyy
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learner1999
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kkeats
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waters的Z-spray设计不是很简洁,导致离子源效率不如AB的好,这样可能有些痕量的代谢产物检测不到,还有天然药物的代谢产物鉴定比人工合成的化学药物要难很多,难上加难吧。

质谱的解谱过程只是一个推断过程,想确证就得人工合成推测产物,比对一下色谱行为和质谱裂解行为。

很多代谢过程是在研究的过程中发现的,这需要大胆的推测,以及建立在已有的代谢途径基础上的知识积累。
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