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主题：【讨论】挥发油鉴定中PBM检索和NIST search 哪种检索方式给出的结果更准确？

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发表于：2010/04/06 15:59:02 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
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在做挥发油鉴定中，发现PBM检索和NIST search给出的检索结果有时不一样， 哪种检索方式给出的结果更准确？为什么！
可以两种结果可以同时应用到一篇文章中吗？例如：分离较好的峰用PBM检索结果，分离度稍差的峰用AMDIS处理后在用 NIST search进样检索。
推荐答案：symmacros回复于2010/04/06
我的看法是PBM检索和NIST search给出的检索结果基本上是一致的。

因为两者使用相似的检索方式。NIST search提供正向检索（标准库的峰与未知谱对照，看看谱库中是否存在与未知谱相同的参考谱图）和反向检索（未知谱的峰与标准库对照，看看标准谱中的各质量峰是否出现在未知谱中。忽略在谱库不存在的未知谱上的峰。）

PBM检索也属于反检索。

这样如果使用相同的谱库，例如NIST05，两者给出的结果应该一致。我检验过许多质谱图谱，如果同一数据库（library）结果是一样的。PBM检索相对简单。而NIST search可以给出更多的信息，更细致的图谱分析。例如正检索和反检索结果，保留时间对比及文献参考，图谱解释（spectrum interpreter),同位素分析等。利用这些数据更进一步分析处理图谱。

最终的结果也要参照保留时间或保留指数，挥发油的来源等因素确认。

两种结果可以同时应用到一篇文章中，您可以说明你用过了什么检索方式。分离较好的峰可以直接用PBM检索。分离度稍差的，共流出的或本底干扰大的峰用AMDIS处理后并在Amdis上检索。好像不能在Amdis处理后用NIST search进样检索（更正：可以的）。
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2010/4/6 21:18:47 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我的看法是PBM检索和NIST search给出的检索结果基本上是一致的。

因为两者使用相似的检索方式。NIST search提供正向检索（标准库的峰与未知谱对照，看看谱库中是否存在与未知谱相同的参考谱图）和反向检索（未知谱的峰与标准库对照，看看标准谱中的各质量峰是否出现在未知谱中。忽略在谱库不存在的未知谱上的峰。）

PBM检索也属于反检索。

这样如果使用相同的谱库，例如NIST05，两者给出的结果应该一致。我检验过许多质谱图谱，如果同一数据库（library）结果是一样的。PBM检索相对简单。而NIST search可以给出更多的信息，更细致的图谱分析。例如正检索和反检索结果，保留时间对比及文献参考，图谱解释（spectrum interpreter),同位素分析等。利用这些数据更进一步分析处理图谱。

最终的结果也要参照保留时间或保留指数，挥发油的来源等因素确认。

两种结果可以同时应用到一篇文章中，您可以说明你用过了什么检索方式。分离较好的峰可以直接用PBM检索。分离度稍差的，共流出的或本底干扰大的峰用AMDIS处理后并在Amdis上检索。好像不能在Amdis处理后用NIST search进样检索（更正：可以的）。
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2010/4/7 13:18:22 Last edit by jimzhu
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2010/4/7 8:26:35 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
谢谢了，解释的真详细啊！
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2010/4/7 8:39:17 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我上传一个数据，其中保留时间39.66和46.727的直接PBM检索结果，和经ＡＭＤＩＳ处理后的ＮＩＳＴ　ｓｅａｒｃｈ　检索结果不一样，您有空可以试一下。其他的峰也有类似情况。
实验数据和检索结果请见附件。
附件：
两种检索结果对比.doc
G-H.D.rar
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2010/4/7 9:32:53 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我不确定使用AMDIS及检索时操作是否正确，先把操作步骤的截图上传。
附件：
AMDIS处理过程和ＮＩＳＴ　ｓｅａｒｃｈ操作.pdf
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2010/4/7 9:33:30 Last edit by happyddm
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2010/4/7 13:16:33 地板 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 happyddm(happyddm) 发表:
我不确定使用AMDIS及检索时操作是否正确，先把操作步骤的截图上传。


大致看了一下操作过程。

不清楚C8-C40.MSL是不是用于正构烷的检索的？在分析处理挥发油样品时 选用这个数据库时，不合适。可能用NISTFF.MSL(一个小型香精香料Amdis检索谱库）稍好些。最好自建相应的谱库，或者从别的库转来MSL库来用。 Type of analysis如果选用RIcalibration/performance，你的MSL库中必须包含每个化合物的保留指数。如果没有保留指数，则只能选simple。

一般在Amdis上直接进行数据处理，给出结果。除非有什么更细致的检索需要，才会转入NIST search（go to NIST MS program）做进一步的处理。

实际上，你是在Amdis转了一下，并未使用其检索和保留指数校正，而进入NIST search。 有时间，我再看看你的PBM和NIST检索的结果。

有关Amdis的使用，请参考：
【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用
http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20091226/2294579/

和【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件初步介绍（续）
http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20100117/2352775/



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2010/4/7 20:45:40 6楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
大致用PBM和Nist search看了看。

E-1,9-Tetradecadiene，C14H26，分子量：194，保留指数大概1373。

39.66分钟，估计要在1400以上，分子量也不对，这里大概是208，比194大14，即一个CH2，所以这个化合物可能是15个碳的二烯，M208，而不是Tetradecadiene。
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2010/4/7 21:14:56 7楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
对46.727min, 通过对PBM和Nist检索分析和对比其它谱库，本人倾向Name: 2-Naphthalenemethanol, 1,2,3,4,4a,5,6,7-octahydro-à,à,4a,8-tetramethyl-, (2R-cis)-，C15H26O（或称作γ-eudesmol)
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2010/4/8 8:27:24 8楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
大致用PBM和Nist search看了看。

E-1,9-Tetradecadiene，C14H26，分子量：194，保留指数大概1373。

39.66分钟，估计要在1400以上，分子量也不对，这里大概是208，比194大14，即一个CH2，所以这个化合物可能是15个碳的二烯，M208，而不是Tetradecadiene。


在鉴定过程中，对于检索结果，不一定匹配值最高的就是最后的结果，还要先比对分子量是否能对得上，是吗？
那以您的经验，在鉴定过程中，一般要依次经过哪些步骤的筛查和分析呢，才能高效准确进行鉴定呢？谢谢！
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2010/4/8 10:57:00 9楼 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
不一定匹配值最高的就是最后的结果，还要先比对分子量，保留时间，标样，样品来源等信息来确认。鉴定是一个比较复杂的过程，首先要有好的数据谱库，最好有保留指数库，仔细的分析（包括有关软件），熟悉挥发油的组成等等。
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