主题:【已应助】【求助】AMDIS具体有什么用和怎么用?

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princefield
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
AMDIS 软件由美国国家标准技术研究院(NIST)(National Institute of Standards and Technology)提供。
The Automatic Mass Spectral Deconvolution and Identification System (AMDIS)
自动质谱图解卷积和鉴定系统软件(AMDIS)让您从GC/MS数据文件自动找到目标化合物。软件先对GC/MS数据文件解卷积寻找所有分离组分。每一组分与目标化合物的谱库进行对比。如果以上的用户设定值,然后报告出目标图谱和解卷了组分的图谱的匹配因子。

什么是解卷积(Deconvolution)?
NIST AMDIS的定义:“这里所用的术语在广义上是指从一个复杂的混合物中提取信号。 解卷积的过程包括处理噪音、校正漂移、从紧密相邻的共洗脱峰中提取出单个峰等。” (简单讲就是去复杂化)

参考:【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用
http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20091226/2294579/


“自动质谱图解卷积和鉴定系统软件(AMDIS)让您从GC/MS数据文件自动找到目标化合物”

软件不是有个MS数据库直接可以搜索吗?这样就不用那么费劲去搞那个AMDIS了
symmacros
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原文由 princefield(princefield) 发表:
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AMDIS 软件由美国国家标准技术研究院(NIST)(National Institute of Standards and Technology)提供。
The Automatic Mass Spectral Deconvolution and Identification System (AMDIS)
自动质谱图解卷积和鉴定系统软件(AMDIS)让您从GC/MS数据文件自动找到目标化合物。软件先对GC/MS数据文件解卷积寻找所有分离组分。每一组分与目标化合物的谱库进行对比。如果以上的用户设定值,然后报告出目标图谱和解卷了组分的图谱的匹配因子。

什么是解卷积(Deconvolution)?
NIST AMDIS的定义:“这里所用的术语在广义上是指从一个复杂的混合物中提取信号。 解卷积的过程包括处理噪音、校正漂移、从紧密相邻的共洗脱峰中提取出单个峰等。” (简单讲就是去复杂化)

参考:【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用
http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20091226/2294579/


“自动质谱图解卷积和鉴定系统软件(AMDIS)让您从GC/MS数据文件自动找到目标化合物”

软件不是有个MS数据库直接可以搜索吗?这样就不用那么费劲去搞那个AMDIS了


不知道您仔细看过有关Amdis的介绍没有?软件的MS数据库直接搜索和MS数据的前处理是不一样的。Amdis对重叠峰(共流峰),基质干扰,大峰里的痕量化合物等的拆分,这是一般的工作站无法得到的。
ruan651209
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
在分离的样品很简单,组分单一或组分少,在柱子上能够良好分离的情况下,基质对目标物干扰很小或无干扰时,大峰上没有目标物,Amdis就没什么用处,也无必要。

另外在没有良好的Amdis谱库(不是在工作站上检索的谱库,而是MSL库),也毫无用处。

Amdis的相关参数的设置不合理不正确的情况下,使用效果也不好。

如果有保留指数库,准确性讲大大提高,有时候是必要的。



有点明白,原来一直认为和卡氏滤波之类的算法稳定性相当,
看来学得透,用得顺的。
xiguihu
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原文由 symmacros(jimzhu) 发表:
不知道您仔细看过有关Amdis的介绍没有?软件的MS数据库直接搜索和MS数据的前处理是不一样的。Amdis对重叠峰(共流峰),基质干扰,大峰里的痕量化合物等的拆分,这是一般的工作站无法得到的。
刚接触AMDIS一无所知  我如何学习呢?
symmacros
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原文由 xiguihu(xiguihu) 发表:
刚接触AMDIS一无所知  我如何学习呢?
可以先看看相关的介绍资料和说明书等,试着用。
florius
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感觉这个软件对于在复杂基质中寻找信号比较小的物质是比较有用的,而且它可以给出一个处理后的质谱图帮助定性,这个谱图比我们在原始数据上简单地扣除背景得到的更精确和真实。不过对于一般以定量分析为主的商业实验室而言使用比较少。
该帖子作者被版主 jimzhu2积分, 2经验,加分理由:参与。
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