主题：【求助】请教用质谱的方法进行DNA点突变的分析

原文由 去年冬天(7336167) 发表:
国内有哪里用质谱进行DNA序列的研究的吗?
复旦大学有这方面的研究。

原文由 xxqu0516(xxqu0516) 发表:

原文由 去年冬天(7336167) 发表:
国内有哪里用质谱进行DNA序列的研究的吗?
复旦大学有这方面的研究。

谢谢您的回复～～ 不知道具体是复旦哪里呢？

另外这种方法到底可行吗？没有人做过这方面的尝试吗？

原文由 xxqu0516(xxqu0516) 发表:
大家好

最近在做DNA点突变的研究,由于基因很大,有七十几个外显子,如果一一扩增测序的话成本和时间上都不划算.

所以在考虑能否用质谱的方法，或者其他什么分析的方法先进行下初筛。

和标样比较，如果看到了某个峰有异常的话，再专门扩增这个外显子去测序

外显子一般200－300bp。

想请教大家，不知道用质谱的方法可不可以？另外，国内有哪里用质谱进行DNA序列的研究的吗?

我知道用MALDI-TOF-TOF这个进行SNP的研究，但是对于我们这个200－300bp来说量程上就太小了。

期待大家的回答～～～～

原文由 monod(monod) 发表:

原文由 xxqu0516(xxqu0516) 发表:
大家好

最近在做DNA点突变的研究,由于基因很大,有七十几个外显子,如果一一扩增测序的话成本和时间上都不划算.

所以在考虑能否用质谱的方法，或者其他什么分析的方法先进行下初筛。

和标样比较，如果看到了某个峰有异常的话，再专门扩增这个外显子去测序

外显子一般200－300bp。

想请教大家，不知道用质谱的方法可不可以？另外，国内有哪里用质谱进行DNA序列的研究的吗?

我知道用MALDI-TOF-TOF这个进行SNP的研究，但是对于我们这个200－300bp来说量程上就太小了。

期待大家的回答～～～～

查下相关文献就知道大致哪些人在做了。应该还是蛮多的。不过这个分子量太大了，8k以下还可以试着做。可以考虑在其他的平台上尝试下。和ABI（不是AB Sciex）联系下看看。

原文由 maldiguy(maldiguy) 发表:
如果只想找SNP位点，一般的MALDI-TOF就可以了
现在sequenom在国内推广得不错
其他MALDI-TOF平台也可以做，但数据分析上有麻烦
但200个BP，分子量60k以上，做起来就麻烦了