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主题：【分享】蛋白质组数据分析综述

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moryan
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发表于：2011/07/26 15:08:18 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
基于高通量的质谱技术方法，目前，各种疾病相关的差异蛋白质组数据高速增长。但是要从这些数据中发现生物学规律，挖掘得到疾病相关的生物标记物，以及发现潜在的疾病药物靶标，还有很艰难的数据分析任务需要完成。需要借助生物信息学的工具，去综合现有数据库数据及文献数据的知识，对这些蛋白质进行综合分析。

发表于蛋白质组学杂志上的一篇综述From proteome lists to biological impact-tools and strategies for the analysis of large MS data sets. （Rainer et.al,. Proteomics 2010,10.1270-1283）很好地概括了面对海量的蛋白质组数据这个艰巨的任务时，生物学家和生物信息学家共同发展的数据分析策略和方法，从而数据中挖掘出隐藏的生物学知识。文章介绍了数据预处理过程（如ID转换）、功能富集分析、网络分析及蛋白质性质分析（如PTM, domain，motif）等工具；另外，还介绍了随着实验数据增长起来的文献数据的文本挖掘方法。
附件：
From proteome list to biological impact.pdf
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2011/7/26 16:03:15 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
大家在蛋白质组数据分析上有什么好的文章及工具，请讨论，分享，共同进步。
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2011/7/26 16:19:56 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
分享一篇文章：《蛋白质组和蛋白质组数据分析：当前蛋白质-仿形技术概要》
链接：http://202.38.126.151/index.php/%E8%9B%8B%E7%99%BD%E8%B4%A8%E7%BB%84%E5%AD%A6%E5%92%8C%E8%9B%8B%E7%99%BD%E8%B4%A8%E7%BB%84%E6%95%B0%E6%8D%AE%E5%88%86%E6%9E%90#.E6.95.B0.E6.8D.AE.E8.BD.AC.E6.8D.A2
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