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主题：【讨论】论坛里有没有人做基于LCMS代谢组组方面的研究，交流一下吧吧

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lzhwin
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发表于：2012/12/26 11:03:21 楼主 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
我刚刚开始这方面的涉入，很多很多地方都没有弄明白，想问一下下有没有人也做这方面的实验呢?

我目前使用的是一台热电LTQ-orbitrap质谱，全扫描模式跑全谱之后用基于R的一系列软件包来进行后续数据处理

简单来说：

1、MSConvert（这个是独立软件）将热电的raw文件转换为mzXML文件

2、XCMS软件包进行特征识别、分组、填充缺失组分、寻找差异等工作

3、CAMERA软件包对特征峰进行同位素峰以及各种离子加成峰的识别

后面怎么检索库还没搞明白。
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yellow47
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2012/12/27 15:55:06 沙发 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
thermo自己的exactfinder和massfrontier就可以实现你想要的这些功能了吧，sieve可以用来差异化比较
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dark_wzy
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2013/1/10 21:41:22 板凳 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
不论是谁家的软件，都是基于多元统计分析，找到差异组分（质荷比），然后结合Chemspider、KEGG、HMDB等数据库或者各家自己的数据库进行检索，在经过未知物解析软件对于同分异构体进行确认。
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2016/10/25 19:57:26 马扎 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
你好，MSConvert 软件可以发给我一份吗？自己下了好久下不下来，我的邮箱1905878206@qq.com
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p3082586
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2017/2/19 12:18:24 地毯 管理 分享 倒序浏览 只看楼主 回复 私聊
你好，MSConvert 软件可以发给我一份吗？我的邮箱861020224@qq.com
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